30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3154 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  65.83 
 
 		 277 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  65.11 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  64.75 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  64.75 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  62.95 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  62.95 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  62.09 
 
 		 280 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  48.8 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  49.4 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  49 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  48.81 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  49.4 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  48.02 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  46.07 
 
 		 268 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  46.67 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  47.11 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  36.25 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  36.25 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  35.38 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  35.89 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  24.3 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  34.9 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  23.94 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 474 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  29.14 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  33.7 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.76 
 
 		 344 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>