26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4008 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  68.7 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  65.17 
 
 		 290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 275 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  44.84 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  43.41 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  43.48 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  44.66 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  43.7 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  40.23 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  40.56 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  41.15 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  38.67 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  35.66 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  36 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  36.25 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  36.86 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  36.86 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  36.86 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  27.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  30.09 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  25.1 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>