28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4362 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  100 
 
 		 295 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  68.98 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  68.98 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  61.77 
 
 		 290 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  42.14 
 
 		 275 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  46.85 
 
 		 266 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  44.05 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  45.67 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  42.8 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  43.65 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  41.67 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  41.67 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  42.56 
 
 		 268 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  40.16 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 278 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  40 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  39.37 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  35.9 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  32.58 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 487 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 147 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  23.29 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  24.62 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>