34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1775 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  27.47 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  33.57 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  25.52 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  24.73 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  28.72 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  32.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  30.99 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  28 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  31.47 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  23.63 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  31.55 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  26.05 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  26.79 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  27.71 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  32.08 
 
 		 104 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  30.09 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  30.09 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  25.33 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  36.49 
 
 		 828 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.11 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  29.14 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 98 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 117 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>