113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0910 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  86.32 
 
 		 117 aa  186  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  42.35 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  36.07 
 
 		 253 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0243  hypothetical protein  34.82 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 311 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1460  hypothetical protein  35.71 
 
 		 428 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1555  hypothetical protein  35.71 
 
 		 428 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2403  hypothetical protein  34.82 
 
 		 428 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  32.61 
 
 		 327 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  27.43 
 
 		 277 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2850  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 312 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  38.67 
 
 		 256 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.71 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  27.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  34.25 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  47.17 
 
 		 593 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 278 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  33.75 
 
 		 266 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 278 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  43.64 
 
 		 363 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  32.52 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  26.21 
 
 		 349 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  25.24 
 
 		 349 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  25.24 
 
 		 349 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  47.83 
 
 		 968 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 356 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2122  cytochrome c, class I  26.98 
 
 		 312 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.959895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  47.5 
 
 		 1110 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  32.5 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  33.33 
 
 		 372 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  30.26 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 372 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  41.38 
 
 		 1077 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  29.59 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 278 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  31.58 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 381 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  31.25 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  32.53 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  32.1 
 
 		 557 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  44.9 
 
 		 1023 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.55 
 
 		 1191 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  24.27 
 
 		 349 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  46.94 
 
 		 1084 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  28.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  28.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 340 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  35.24 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  32.88 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  30.56 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  27.83 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  28.57 
 
 		 367 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  33.78 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1946  cytochrome c, class I  25 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  29.21 
 
 		 435 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  31.4 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  31.87 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  28.05 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  32.91 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 318 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  27.06 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.09 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  30.58 
 
 		 126 aa  42  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  27.43 
 
 		 244 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  28.38 
 
 		 556 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  29.32 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  26.83 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  27.45 
 
 		 338 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  27.07 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  29.76 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  29.21 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  30.12 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 		 705 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  31.11 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  27.16 
 
 		 336 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>