79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0461 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  100 
 
 		 556 aa  1134    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  44.01 
 
 		 557 aa  462  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  33.89 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  31.15 
 
 		 517 aa  260  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  31.97 
 
 		 504 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  29.89 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  30.15 
 
 		 493 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  28.45 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  32.79 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  29.89 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  31.73 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  30.58 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  27.81 
 
 		 542 aa  224  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  27.81 
 
 		 566 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  27.57 
 
 		 525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  27.79 
 
 		 547 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  23.99 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.66 
 
 		 548 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  22.71 
 
 		 690 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  23.27 
 
 		 527 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  22.59 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  23.94 
 
 		 519 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  22.99 
 
 		 575 aa  100  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  22.09 
 
 		 568 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  21.7 
 
 		 568 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  21.5 
 
 		 567 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  22.66 
 
 		 565 aa  94  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  22.43 
 
 		 576 aa  93.6  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  23.97 
 
 		 596 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  22.5 
 
 		 574 aa  92  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  22.5 
 
 		 574 aa  92  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  22.75 
 
 		 546 aa  90.5  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  21.37 
 
 		 573 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  22.37 
 
 		 574 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  21.5 
 
 		 549 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1986  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 101 aa  86.7  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  21.29 
 
 		 560 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  19.65 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  20.77 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  21.43 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  22.16 
 
 		 583 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  20.43 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  19.25 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  22.76 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  21.75 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  20.42 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  21.22 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  21.53 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  21.02 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  18.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  18.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 350 aa  50.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  40 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 519 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  29.91 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  35.44 
 
 		 199 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 101 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 149 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  17.93 
 
 		 397 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 		 511 aa  47.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  34.07 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  32.05 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 156 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  32.5 
 
 		 647 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  27.71 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 		 387 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  32.43 
 
 		 380 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 401 aa  43.9  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.34 
 
 		 531 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 154 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>