151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1946 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1946  cytochrome c, class I  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1677  cytochrome C2  92.72 
 
 
151 aa  266  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  52.98 
 
 
169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  34.53 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  42.71 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  31.16 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00210  cytochrome C2  42.57 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  36.61 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  38.64 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  36 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  35.05 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1644  cytochrome c class I  37 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  35.51 
 
 
235 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  37.11 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  34.82 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  38.18 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  35.92 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  34.75 
 
 
225 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  39.05 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  39.05 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  34.31 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  34.65 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  32.99 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  36.36 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  30.93 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  33.66 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  36.54 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  33.93 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  34.38 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  37.65 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  35.34 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  33.66 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  34.69 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.35 
 
 
308 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  30.32 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  41.38 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  33.98 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  30.1 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  35.64 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  34.02 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  35.64 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  34.02 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  35.51 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  40.23 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  34 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  36.67 
 
 
296 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2672  hypothetical protein  36.08 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0619272  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  40.23 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  26.56 
 
 
329 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  32.67 
 
 
236 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  33.33 
 
 
224 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  35.45 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  38.1 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  30.23 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  36.04 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  32.65 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  35.23 
 
 
342 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  38.1 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  31.43 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  31.25 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  31.25 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  36 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  38.37 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  30.61 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  38.71 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  38.71 
 
 
130 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  31.87 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  36.36 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  32.04 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  32.65 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  34.09 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
382 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  33.33 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  32.04 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  33.01 
 
 
202 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  32.99 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  30.43 
 
 
286 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  33.01 
 
 
192 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  33.72 
 
 
183 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  33 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  33.65 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  33.67 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3439  cytochrome c2  30.53 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  34 
 
 
186 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  35.23 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0377  cytochrome c, class I  32.89 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  29.71 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  29.9 
 
 
426 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  37 
 
 
307 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  30.77 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  30.11 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  34.04 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3100  cytochrome c class I  30.93 
 
 
429 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00535618  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0404  cytochrome c, class I  32.99 
 
 
427 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06087  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>