297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4298 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 356 aa  742    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  54.58 
 
 		 363 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  55.48 
 
 		 327 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  53.27 
 
 		 327 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  53.87 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  53.92 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  36.22 
 
 		 207 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  30.29 
 
 		 216 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 221 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 221 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 228 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  33.94 
 
 		 221 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  35.47 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  29.83 
 
 		 222 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  43.81 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 218 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  34.08 
 
 		 208 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  30.27 
 
 		 218 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  32.05 
 
 		 193 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  40.86 
 
 		 326 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 193 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  31.37 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  37.96 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  43.01 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  28.06 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  28.37 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  32.89 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.63 
 
 		 487 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  37.63 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.63 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.63 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.63 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  34.58 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  36.52 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  33.04 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  27.07 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  30.26 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  27.82 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  31 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  31 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  31 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  31 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  31 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.21 
 
 		 435 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  30.36 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 706 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.93 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.2 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.93 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.2 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  29.17 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>