More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2002 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 363 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  65.17 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  61.2 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  60.88 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  56.18 
 
 		 356 aa  348  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  54.7 
 
 		 340 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 222 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  39.52 
 
 		 221 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 221 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 221 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  39.35 
 
 		 221 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  40.62 
 
 		 228 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 218 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 216 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  31.48 
 
 		 218 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  32.99 
 
 		 218 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  38.62 
 
 		 208 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  34.07 
 
 		 198 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  39.64 
 
 		 296 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  32.66 
 
 		 194 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  30.22 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 236 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 193 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  31.45 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  42.39 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  35.83 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  35.83 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  35 
 
 		 200 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  35.83 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  40.22 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.9 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  37.38 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  37.62 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  32.95 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  34.23 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.22 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  33.56 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  33.56 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  31.03 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  33.56 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  33.56 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  33.56 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  31.03 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  33.56 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  33.56 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  29.15 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  39.36 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  29.26 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  33.99 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  38.3 
 
 		 201 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 219 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 		 196 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.3 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>