70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5926 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  31.36 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  29.96 
 
 
255 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.45 
 
 
255 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  27.62 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  26.29 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  26.29 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  26.29 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  28.02 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  26.29 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.45 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.45 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.02 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  28.45 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.09 
 
 
488 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2956  cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  35.71 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  29.46 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2710  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  35.25 
 
 
426 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35 
 
 
358 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  35.25 
 
 
429 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  34.68 
 
 
422 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  34.68 
 
 
431 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  32.79 
 
 
421 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  34.75 
 
 
367 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.97 
 
 
431 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.62 
 
 
367 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  34.04 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  33.87 
 
 
367 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  31.15 
 
 
429 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  23.85 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  33.6 
 
 
367 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.3 
 
 
439 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  29.1 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21841  cytochrome b6-f complex subunit IV  36.27 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  32.12 
 
 
575 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1136  cytochrome b6-f complex subunit IV  36.27 
 
 
160 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.392758  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.15 
 
 
421 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  36.27 
 
 
160 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  30.72 
 
 
414 aa  45.4  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  22.86 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  27.86 
 
 
449 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03501  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.33 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  37.68 
 
 
698 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03521  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.33 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  32.14 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  32.14 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1848  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.53 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.342788  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0332  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.33 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  30.97 
 
 
469 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.41 
 
 
531 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000370205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03581  cytochrome b6-f complex subunit IV  32.32 
 
 
160 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.170211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  28.38 
 
 
580 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.27 
 
 
429 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  30.46 
 
 
583 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  34.72 
 
 
117 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  26.11 
 
 
421 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04181  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.53 
 
 
160 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  28.46 
 
 
690 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  30.14 
 
 
410 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1703  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.53 
 
 
160 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  27.56 
 
 
417 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  27.45 
 
 
419 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.71 
 
 
548 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0486  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.86 
 
 
160 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.625856  normal  0.541089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.58 
 
 
160 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.08 
 
 
445 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  29.46 
 
 
415 aa  42  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2120  hypothetical protein  26.15 
 
 
173 aa  42  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697537  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  24.83 
 
 
451 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>