289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0243 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  863    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  77.86 
 
 		 425 aa  677    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  46.62 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  38.39 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  35.99 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  38.83 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  38.77 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  36 
 
 		 557 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  35.57 
 
 		 559 aa  230  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  35.24 
 
 		 583 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.57 
 
 		 582 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  34.75 
 
 		 580 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  35.49 
 
 		 543 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.84 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  33.95 
 
 		 566 aa  216  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  34.93 
 
 		 553 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  33.79 
 
 		 545 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  33.64 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  34.27 
 
 		 564 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  37.82 
 
 		 535 aa  209  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.25 
 
 		 536 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.1 
 
 		 532 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  34.7 
 
 		 575 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  36.26 
 
 		 551 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.92 
 
 		 536 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  32.37 
 
 		 561 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  35.06 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  33.9 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.84 
 
 		 568 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  34.21 
 
 		 537 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  34.25 
 
 		 545 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  34.63 
 
 		 548 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  33.86 
 
 		 564 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.43 
 
 		 542 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  36.24 
 
 		 553 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  33.64 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  32.4 
 
 		 542 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  31.17 
 
 		 581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  33.57 
 
 		 541 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  35.03 
 
 		 549 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.51 
 
 		 557 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.03 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.79 
 
 		 558 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  32.79 
 
 		 558 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.79 
 
 		 558 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  34.41 
 
 		 551 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  38.2 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  37.77 
 
 		 224 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  36.91 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  29.55 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  40.53 
 
 		 268 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  37.11 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  31.67 
 
 		 575 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  29.58 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  33.2 
 
 		 269 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.25 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  32.23 
 
 		 267 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  28.57 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  30.11 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  34.07 
 
 		 222 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  34.96 
 
 		 215 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  29.01 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  27.78 
 
 		 367 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  29.01 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  33.63 
 
 		 218 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.51 
 
 		 215 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  34.07 
 
 		 218 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  33.19 
 
 		 222 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  33.19 
 
 		 222 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  28.73 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  33.19 
 
 		 218 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.14 
 
 		 367 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  32.2 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  32.3 
 
 		 215 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  33.19 
 
 		 222 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  30.47 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  30.15 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  29 
 
 		 747 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  28.28 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.73 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  26.68 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>