294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0278 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  100 
 
 
417 aa  833    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.4 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  49.25 
 
 
417 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  51.49 
 
 
425 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  49.25 
 
 
689 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  48.75 
 
 
690 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  48.58 
 
 
689 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  49.75 
 
 
426 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  48.58 
 
 
688 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  48.75 
 
 
687 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.43 
 
 
426 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  47.75 
 
 
688 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  48.71 
 
 
688 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  46.41 
 
 
426 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  49.61 
 
 
430 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  49.63 
 
 
405 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.28 
 
 
439 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.36 
 
 
421 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.89 
 
 
424 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.22 
 
 
430 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  47.9 
 
 
422 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  47.92 
 
 
428 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  49.22 
 
 
430 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.12 
 
 
428 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  46.02 
 
 
410 aa  377  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.74 
 
 
420 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  48.62 
 
 
428 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  45.37 
 
 
428 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  45.37 
 
 
422 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  47.68 
 
 
432 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  44.85 
 
 
429 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.19 
 
 
431 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  47.19 
 
 
432 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  43.5 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.75 
 
 
408 aa  349  5e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  41.77 
 
 
409 aa  346  4e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  42.99 
 
 
451 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.57 
 
 
445 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  43.19 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.96 
 
 
445 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  43.09 
 
 
442 aa  339  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.13 
 
 
401 aa  338  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  43.83 
 
 
449 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  43.95 
 
 
410 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  42.57 
 
 
410 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  43.39 
 
 
404 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  42.61 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  43.14 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  42.36 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  40 
 
 
466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.42 
 
 
466 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  44.58 
 
 
403 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.72 
 
 
410 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  43.03 
 
 
408 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  41.25 
 
 
414 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  43.17 
 
 
413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.86 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  41.61 
 
 
433 aa  318  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  39.81 
 
 
459 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  40.57 
 
 
426 aa  316  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.03 
 
 
404 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.03 
 
 
404 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  40.32 
 
 
459 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  39.58 
 
 
459 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.5 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.09 
 
 
459 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.5 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  40.89 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.82 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.78 
 
 
404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  45.41 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.82 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  42.11 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.11 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  43.2 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  43.11 
 
 
403 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.85 
 
 
403 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.11 
 
 
404 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.11 
 
 
404 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.79 
 
 
404 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.03 
 
 
404 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.05 
 
 
460 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  43.03 
 
 
404 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.18 
 
 
404 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.04 
 
 
404 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.54 
 
 
404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  41.25 
 
 
401 aa  310  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.29 
 
 
404 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.54 
 
 
404 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  40.75 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  40.77 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  42.74 
 
 
469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.03 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  43.28 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  42.11 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.13 
 
 
460 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.54 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  38.38 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  41.11 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.83 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>