More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1395 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  93.93 
 
 		 445 aa  855    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  81.99 
 
 		 449 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  100 
 
 		 445 aa  896    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  79.18 
 
 		 451 aa  725    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  81.78 
 
 		 442 aa  736    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  99.78 
 
 		 445 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  84.63 
 
 		 440 aa  744    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  60.66 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  60.9 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  59.72 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  58.08 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  58.31 
 
 		 432 aa  488  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.77 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  58.74 
 
 		 426 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.79 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.08 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  57.38 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  56.91 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  58.08 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  57.98 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  56.67 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.12 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.64 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.28 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  56.29 
 
 		 690 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  56.43 
 
 		 688 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  55.94 
 
 		 687 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  56.67 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  56.43 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  55.5 
 
 		 409 aa  461  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  55.61 
 
 		 688 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  53.22 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.09 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  53.46 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.46 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  52.82 
 
 		 408 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  53.74 
 
 		 688 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  52.01 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.07 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  54.5 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  53.81 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  52.74 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.03 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.88 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  45.3 
 
 		 410 aa  342  9e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.68 
 
 		 466 aa  338  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  43.06 
 
 		 466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  46.75 
 
 		 747 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  43.56 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  43.54 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.42 
 
 		 471 aa  329  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  43.96 
 
 		 403 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  43.19 
 
 		 417 aa  328  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  47.13 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  43.72 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  47.24 
 
 		 403 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.58 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  44.42 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.01 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  42.25 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  43.99 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.67 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  43.65 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  45.3 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.3 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.3 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  43.36 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  45.06 
 
 		 403 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  44.1 
 
 		 403 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  43.35 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.82 
 
 		 404 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  43.36 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  43.38 
 
 		 422 aa  319  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  43.1 
 
 		 408 aa  318  9e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.15 
 
 		 467 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  40.42 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.5 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.72 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.27 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  39.95 
 
 		 459 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  45.18 
 
 		 469 aa  316  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  40.27 
 
 		 460 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.27 
 
 		 460 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.5 
 
 		 460 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  42.02 
 
 		 466 aa  315  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.34 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  39.82 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  42.24 
 
 		 426 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.27 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.25 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  43.73 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3092  cytochrome b/b6, N-terminal  42.79 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  43.35 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3229  cytochrome b/b6-like protein  42.56 
 
 		 467 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  43.72 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  41.91 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.03 
 
 		 404 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  43.48 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.03 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  41.48 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>