More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2471 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  98.6 
 
 		 430 aa  858    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  98.6 
 
 		 430 aa  858    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  100 
 
 		 430 aa  864    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  87.83 
 
 		 428 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  88.34 
 
 		 420 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  88.18 
 
 		 428 aa  770    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.71 
 
 		 418 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.85 
 
 		 424 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  68.32 
 
 		 688 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  67.15 
 
 		 687 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  67.73 
 
 		 689 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  68.07 
 
 		 689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  68.49 
 
 		 417 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  69.17 
 
 		 688 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  66.03 
 
 		 690 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  66.58 
 
 		 688 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  65.73 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  64.41 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  64.78 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  63.79 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  63.33 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  62.8 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  66.03 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  65.55 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  64.89 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  62.38 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  62.78 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  57.92 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  59.07 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.72 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  56.13 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  54.04 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  56.07 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  54.42 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  53.22 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  53.45 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  53.22 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.74 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.98 
 
 		 445 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.76 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  52.23 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  52.72 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.63 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  49.61 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  47.88 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  48.88 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  48.39 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  48.16 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.16 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  44.83 
 
 		 410 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.16 
 
 		 404 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.16 
 
 		 404 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  45.45 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  45.7 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  44.67 
 
 		 410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  46.93 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.68 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  46.23 
 
 		 459 aa  348  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  42.06 
 
 		 466 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  45.27 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  44.99 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  45.96 
 
 		 421 aa  345  6e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  46.44 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  45.32 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  43.39 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.59 
 
 		 466 aa  342  8e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.57 
 
 		 404 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.57 
 
 		 404 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  45.41 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.05 
 
 		 404 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.57 
 
 		 404 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  45.29 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  45.05 
 
 		 404 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  41.07 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.55 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.79 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  47.11 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.05 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.03 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.65 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.5 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  45.45 
 
 		 422 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.76 
 
 		 404 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  43.3 
 
 		 413 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  44.04 
 
 		 464 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  44.76 
 
 		 404 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.85 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.62 
 
 		 460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.32 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  40.18 
 
 		 459 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.4 
 
 		 459 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  45.34 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  43.4 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.62 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.18 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.18 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  46.52 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  40.18 
 
 		 460 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  40.44 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.46 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>