More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0625 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  100 
 
 
410 aa  826    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  64.44 
 
 
409 aa  546  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  63.54 
 
 
408 aa  535  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  62.41 
 
 
408 aa  531  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  58.15 
 
 
690 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  56.07 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  57.18 
 
 
689 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  55.83 
 
 
430 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.83 
 
 
430 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  56.93 
 
 
689 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  55.45 
 
 
688 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  56.96 
 
 
688 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.1 
 
 
428 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.4 
 
 
425 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  56.64 
 
 
688 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.66 
 
 
424 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  56.79 
 
 
687 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.31 
 
 
418 aa  477  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  56.97 
 
 
428 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  58.4 
 
 
405 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  55.67 
 
 
417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.25 
 
 
420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  54.88 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.81 
 
 
426 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.9 
 
 
439 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  55.12 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  55.31 
 
 
426 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.61 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  53.27 
 
 
422 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  55.96 
 
 
432 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  52.54 
 
 
422 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  53.03 
 
 
426 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.16 
 
 
431 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  55.72 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  51.79 
 
 
442 aa  441  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  52.25 
 
 
428 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.74 
 
 
445 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  52.74 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  51.9 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.51 
 
 
445 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.73 
 
 
440 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53 
 
 
401 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  51.31 
 
 
449 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  50.12 
 
 
410 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  48.51 
 
 
404 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  48.27 
 
 
404 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  46.02 
 
 
417 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  47.24 
 
 
403 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  47.49 
 
 
403 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  47.17 
 
 
433 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  48.37 
 
 
408 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  46.49 
 
 
414 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  45.93 
 
 
410 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  46.36 
 
 
459 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  49.63 
 
 
403 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  46.78 
 
 
419 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  48.11 
 
 
403 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  44.27 
 
 
466 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  46.68 
 
 
413 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  42.92 
 
 
466 aa  362  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  46.65 
 
 
426 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  45.82 
 
 
421 aa  359  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.64 
 
 
404 aa  359  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.13 
 
 
404 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  45.71 
 
 
422 aa  359  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  47.8 
 
 
464 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.79 
 
 
466 aa  358  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  47.88 
 
 
403 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  48.64 
 
 
404 aa  358  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.13 
 
 
404 aa  358  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.39 
 
 
404 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.39 
 
 
404 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.64 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.63 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.88 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.88 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.13 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  47.81 
 
 
747 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.88 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  48.64 
 
 
404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.88 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  47.13 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  48.68 
 
 
469 aa  355  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  44.86 
 
 
459 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  48.39 
 
 
404 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.27 
 
 
470 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.29 
 
 
410 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  44.16 
 
 
459 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.86 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  44.29 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.06 
 
 
459 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.52 
 
 
460 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.52 
 
 
460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  44.73 
 
 
460 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.14 
 
 
404 aa  352  7e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.14 
 
 
404 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.14 
 
 
404 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.64 
 
 
404 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.94 
 
 
471 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.63 
 
 
460 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>