More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7536 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  87.15 
 
 		 428 aa  753    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  96.9 
 
 		 420 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  86.45 
 
 		 430 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 428 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  86.45 
 
 		 430 aa  756    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  86.45 
 
 		 430 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.05 
 
 		 418 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.46 
 
 		 424 aa  614  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  70.9 
 
 		 689 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  70.17 
 
 		 689 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  70.34 
 
 		 688 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  69.34 
 
 		 687 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  68.48 
 
 		 690 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  69.55 
 
 		 688 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  67.22 
 
 		 688 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  65.72 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  67.41 
 
 		 417 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  65.21 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  64.72 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  63.66 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  64.96 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  66.35 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  63.75 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  65.32 
 
 		 431 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  63.79 
 
 		 439 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  65.87 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  63.54 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  59.81 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  60.78 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.97 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  55.42 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  55.1 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  54.4 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  55.12 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  54.76 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  54.9 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.48 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.39 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  54.63 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.39 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  52.84 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  52.1 
 
 		 408 aa  428  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.41 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  48.62 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  49.13 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  50.12 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  49.88 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  47.42 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  48.89 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  47.17 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.89 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  46.51 
 
 		 422 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.89 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  48.65 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  45.91 
 
 		 410 aa  362  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  48.04 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  46.23 
 
 		 410 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  46.95 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  46.47 
 
 		 426 aa  358  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  48.04 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.79 
 
 		 403 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  45.05 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  45.24 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  46.46 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.28 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.1 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.1 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  41.39 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  45.61 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.84 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  45.74 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.1 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  41.74 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  43.57 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.84 
 
 		 404 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.14 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  48.16 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  45.5 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  44.84 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.34 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.59 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.84 
 
 		 404 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.09 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  44.84 
 
 		 404 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  45.16 
 
 		 419 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.96 
 
 		 467 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.84 
 
 		 404 aa  335  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.94 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  43.58 
 
 		 413 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  45.71 
 
 		 747 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  48.51 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  44.69 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  44.56 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  48.01 
 
 		 401 aa  332  8e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.46 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.83 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.83 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  41.57 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.46 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  41.46 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>