142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1136 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1136  cytochrome b6-f complex subunit IV  100 
 
 
160 aa  319  9.000000000000001e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.392758  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2348  cytochrome b6-f complex subunit IV  87.82 
 
 
161 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  85 
 
 
160 aa  280  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  85 
 
 
160 aa  280  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1702  cytb6/f complex subunit IV  82.5 
 
 
160 aa  277  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.75 
 
 
160 aa  276  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3442  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.12 
 
 
160 aa  276  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00315732  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.75 
 
 
160 aa  274  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03501  cytochrome b6-f complex subunit IV  82.5 
 
 
160 aa  270  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03521  cytochrome b6-f complex subunit IV  82.5 
 
 
160 aa  270  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03581  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.12 
 
 
160 aa  270  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.170211  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0332  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.88 
 
 
160 aa  269  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21841  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.25 
 
 
160 aa  269  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1848  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.88 
 
 
160 aa  268  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.342788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0486  cytochrome b6-f complex subunit IV  82.5 
 
 
160 aa  268  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.625856  normal  0.541089 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03621  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.25 
 
 
160 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.582843  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1703  cytochrome b6-f complex subunit IV  80 
 
 
160 aa  264  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04181  cytochrome b6-f complex subunit IV  80 
 
 
160 aa  264  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32458  predicted protein  75.47 
 
 
213 aa  263  8e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658083  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  33.79 
 
 
367 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  45.98 
 
 
688 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  35.77 
 
 
367 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  39.8 
 
 
688 aa  63.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  40.66 
 
 
690 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.6 
 
 
439 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  43.68 
 
 
687 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.89 
 
 
689 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  45.12 
 
 
403 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.5 
 
 
410 aa  60.8  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  36.96 
 
 
688 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  39.33 
 
 
405 aa  60.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  35.92 
 
 
689 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  32.52 
 
 
367 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  32.26 
 
 
367 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.36 
 
 
424 aa  58.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.23 
 
 
408 aa  57.8  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  28.48 
 
 
422 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  37 
 
 
459 aa  57.4  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  36.17 
 
 
408 aa  57.4  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.92 
 
 
425 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.76 
 
 
430 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  39.76 
 
 
430 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  29.8 
 
 
421 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.42 
 
 
420 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  39.76 
 
 
430 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  29.14 
 
 
421 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.37 
 
 
418 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.66 
 
 
421 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.9 
 
 
428 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  34.86 
 
 
421 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  32.97 
 
 
404 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  32.97 
 
 
404 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.17 
 
 
403 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.11 
 
 
409 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  35.37 
 
 
428 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  45.28 
 
 
403 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  38.3 
 
 
410 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  29.3 
 
 
262 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  36.71 
 
 
429 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  30.09 
 
 
426 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  29.63 
 
 
422 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  51.92 
 
 
413 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.14 
 
 
367 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  27.59 
 
 
273 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  46.15 
 
 
403 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  43.4 
 
 
403 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  38.82 
 
 
403 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  40.91 
 
 
421 aa  50.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  34.12 
 
 
419 aa  50.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.4 
 
 
404 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  38.82 
 
 
403 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.4 
 
 
404 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.4 
 
 
404 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  43.64 
 
 
404 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1362  Cytochrome b/b6 domain  36.54 
 
 
419 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367822  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  31.25 
 
 
469 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.82 
 
 
404 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.68 
 
 
421 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  38.57 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.82 
 
 
404 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.46 
 
 
404 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  36.78 
 
 
428 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  31.25 
 
 
254 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  40 
 
 
426 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40 
 
 
404 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1944  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  32.5 
 
 
430 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0553456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  49.02 
 
 
423 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  44.23 
 
 
408 aa  48.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  41.51 
 
 
401 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  41.51 
 
 
401 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  33.08 
 
 
255 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.18 
 
 
404 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  40 
 
 
404 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40 
 
 
404 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.53 
 
 
410 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  35.29 
 
 
417 aa  47.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  36.27 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.71 
 
 
404 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  51.22 
 
 
400 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  30.43 
 
 
422 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>