More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1534 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  100 
 
 
400 aa  793    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  40.54 
 
 
410 aa  298  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  41.75 
 
 
394 aa  295  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  41.25 
 
 
690 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  40.58 
 
 
688 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  41.05 
 
 
689 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  41.84 
 
 
688 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  40.51 
 
 
403 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.58 
 
 
424 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  40.3 
 
 
687 aa  285  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  40.79 
 
 
689 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  40.21 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  39.7 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.72 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  40.2 
 
 
426 aa  282  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  41.84 
 
 
688 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  39.74 
 
 
459 aa  279  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  37.04 
 
 
459 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.81 
 
 
460 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  39.23 
 
 
403 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.81 
 
 
460 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  36.81 
 
 
460 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  39.23 
 
 
403 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.81 
 
 
460 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.05 
 
 
418 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  40.58 
 
 
417 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.59 
 
 
404 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.59 
 
 
404 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.59 
 
 
404 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  39.59 
 
 
403 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.57 
 
 
460 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.85 
 
 
410 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  39.33 
 
 
403 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.57 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  36.89 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.33 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  39.66 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  36.89 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.2 
 
 
410 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  39.25 
 
 
428 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.14 
 
 
401 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  40.71 
 
 
404 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  40.05 
 
 
469 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  40.46 
 
 
404 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  39.59 
 
 
403 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  39.71 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.36 
 
 
430 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  41.36 
 
 
430 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  40.79 
 
 
430 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.94 
 
 
439 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.64 
 
 
410 aa  270  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.9 
 
 
428 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.71 
 
 
466 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.51 
 
 
420 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  37.91 
 
 
413 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  40.86 
 
 
404 aa  265  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  38.48 
 
 
464 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.43 
 
 
460 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  39.33 
 
 
429 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  37.86 
 
 
418 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  37.93 
 
 
401 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  37.86 
 
 
418 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  37.93 
 
 
401 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  35.73 
 
 
466 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.41 
 
 
404 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  37.69 
 
 
426 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  35.98 
 
 
433 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  39.17 
 
 
426 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  35.9 
 
 
466 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  40.06 
 
 
428 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  37.44 
 
 
422 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.85 
 
 
410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.21 
 
 
421 aa  259  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  38.96 
 
 
421 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.43 
 
 
421 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.61 
 
 
460 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.64 
 
 
470 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.41 
 
 
404 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.1 
 
 
404 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  34.71 
 
 
466 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.31 
 
 
421 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  38.23 
 
 
428 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.59 
 
 
404 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.59 
 
 
404 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  39.59 
 
 
404 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.09 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.34 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.34 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  39.43 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.05 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  37.34 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.72 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.72 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.72 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>