52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0577 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3096  cytochrome b(C-terminal)/b6  74.8 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  65.57 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  30.13 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  31.91 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.75 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1702  cytb6/f complex subunit IV  30.29 
 
 		 160 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3442  cytochrome b6-f complex subunit IV  29.71 
 
 		 160 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00315732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  28.16 
 
 		 160 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  25.47 
 
 		 367 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.86 
 
 		 160 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.86 
 
 		 160 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  23.5 
 
 		 437 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03521  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.29 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03501  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.29 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114467  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  29.85 
 
 		 464 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0332  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03581  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.29 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.170211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21841  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.29 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  25.6 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1136  cytochrome b6-f complex subunit IV  27.59 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.392758  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04181  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.71 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1703  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.71 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.28 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  28.38 
 
 		 472 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  25.38 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03621  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.14 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  25.75 
 
 		 449 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2348  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.67 
 
 		 161 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  22.86 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  24.65 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  26.56 
 
 		 687 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.58 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32458  predicted protein  23.17 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658083  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  25 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1848  cytochrome b6-f complex subunit IV  23.56 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.342788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.31 
 
 		 440 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  25.15 
 
 		 414 aa  42.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.53 
 
 		 367 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>