45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3096 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3096  cytochrome b(C-terminal)/b6  100 
 
 		 255 aa  523  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  74.8 
 
 		 273 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  64.31 
 
 		 262 aa  352  5e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  31.85 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.64 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  27.68 
 
 		 488 aa  55.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  25.16 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  27.91 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  24.2 
 
 		 367 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  25.95 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  25.64 
 
 		 464 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  26.9 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  25.58 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  25.41 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.99 
 
 		 160 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 416 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 416 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  32.97 
 
 		 416 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  24.59 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.81 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  22.44 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  22.44 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1702  cytb6/f complex subunit IV  24.86 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 		 386 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  26.21 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  24.35 
 
 		 367 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3442  cytochrome b6-f complex subunit IV  24.86 
 
 		 160 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00315732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  23.67 
 
 		 449 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  25.77 
 
 		 559 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  21.91 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  30.49 
 
 		 418 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  30.49 
 
 		 418 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  25.24 
 
 		 404 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  33.8 
 
 		 415 aa  42.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  24.14 
 
 		 451 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  21.6 
 
 		 440 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  32.81 
 
 		 414 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>