283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0117 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 386 aa  784    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  41.62 
 
 		 418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  41.62 
 
 		 418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  42.42 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  43.25 
 
 		 415 aa  299  4e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  43.24 
 
 		 414 aa  299  6e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  41.87 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  41.87 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  41.87 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  42.82 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  41.62 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  41.22 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  37.8 
 
 		 404 aa  270  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  36.41 
 
 		 459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  35.9 
 
 		 688 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  34.84 
 
 		 690 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  35.64 
 
 		 689 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.54 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  30.87 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  35.9 
 
 		 688 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  34.37 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.56 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.11 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.29 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  35.11 
 
 		 689 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  32.19 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  35.71 
 
 		 688 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  35.11 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.81 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  34.75 
 
 		 469 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  31.93 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  33.68 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  31.66 
 
 		 403 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  35.9 
 
 		 687 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  32.19 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  33.76 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.59 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  33.85 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  33.08 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  35.26 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.58 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  32.11 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  33.33 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  33.16 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  32.98 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  31.22 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  37.97 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  30.32 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  33.76 
 
 		 451 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  32.99 
 
 		 449 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  32.45 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  32.72 
 
 		 404 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  32.82 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  36.07 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.71 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  35.11 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.59 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.61 
 
 		 747 aa  189  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  30.32 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  31.12 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.59 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  34.49 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.38 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  35.04 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.05 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.05 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  33.6 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.6 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.48 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  30.79 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  33.33 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  32.18 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  32.63 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.75 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  31.62 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.45 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.54 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.86 
 
 		 439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  27.88 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  34.67 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.55 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.87 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.93 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.71 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  29.66 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.6 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  33.83 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  29.84 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.93 
 
 		 404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  32.62 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  33.05 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.66 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.81 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  30.37 
 
 		 459 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.11 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  29.57 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.37 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.37 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.37 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.84 
 
 		 460 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>