292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1449 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  77.35 
 
 		 416 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  77.11 
 
 		 416 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  76.87 
 
 		 416 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  77.91 
 
 		 414 aa  655    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 415 aa  836    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  75.54 
 
 		 419 aa  639    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  72.24 
 
 		 414 aa  622  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  73.79 
 
 		 414 aa  623  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  69.88 
 
 		 418 aa  609  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  69.88 
 
 		 418 aa  609  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  62.08 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  53.37 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  41.82 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  38.89 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  42.05 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  39.05 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  38.65 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  40.36 
 
 		 410 aa  272  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  43.19 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.44 
 
 		 421 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  37.75 
 
 		 688 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  40 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  40 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  40 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.45 
 
 		 403 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  40.2 
 
 		 422 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  39.36 
 
 		 688 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.48 
 
 		 445 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.47 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  38.86 
 
 		 689 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.72 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  40.45 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  37.8 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  38.72 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  36.39 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.45 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.45 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  41.27 
 
 		 403 aa  264  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.45 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  38.08 
 
 		 690 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  38.71 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.21 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  36.14 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.2 
 
 		 410 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  38.96 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  37.68 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  37.87 
 
 		 689 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.11 
 
 		 440 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  37.59 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.29 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  39.95 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  36.26 
 
 		 451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  38.96 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.59 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.47 
 
 		 418 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  38.21 
 
 		 417 aa  259  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  38.99 
 
 		 747 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  42.29 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  36.26 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 		 460 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  38.68 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  36.26 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  37.99 
 
 		 687 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  36.24 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 		 460 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  37.59 
 
 		 460 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  42.09 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  38.35 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.09 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.09 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  37.01 
 
 		 688 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.44 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.82 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  41.22 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.76 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.76 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.84 
 
 		 460 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.82 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.82 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.59 
 
 		 432 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.22 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.55 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.22 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  43.69 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.22 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.21 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  36.88 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.68 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.2 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  43.87 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  41.02 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.7 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  38.3 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.29 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  41.29 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  39.9 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  35.4 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>