286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1832 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 
418 aa  847    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 
418 aa  847    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  73.85 
 
 
414 aa  632  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  75.83 
 
 
416 aa  628  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  75.83 
 
 
416 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  75.57 
 
 
416 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  69.25 
 
 
414 aa  590  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  69.25 
 
 
414 aa  586  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  69.88 
 
 
415 aa  585  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  68.42 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  65.54 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  55.75 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  41.62 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  44.22 
 
 
459 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  40.24 
 
 
429 aa  282  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.39 
 
 
401 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  39.23 
 
 
410 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  41.83 
 
 
403 aa  279  7e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  45.32 
 
 
469 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  39.95 
 
 
422 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  39.01 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  39.85 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.14 
 
 
445 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.38 
 
 
445 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  40.38 
 
 
445 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  39.56 
 
 
451 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.22 
 
 
466 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.85 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  40.57 
 
 
426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  38.2 
 
 
414 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  36.24 
 
 
466 aa  269  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.22 
 
 
460 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.71 
 
 
440 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  40.39 
 
 
408 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  37.16 
 
 
460 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  38.83 
 
 
426 aa  266  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  38.52 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.81 
 
 
460 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.22 
 
 
459 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  43.02 
 
 
464 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  37.25 
 
 
403 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.67 
 
 
460 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  38.5 
 
 
747 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  38.86 
 
 
403 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  36.55 
 
 
459 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  37.25 
 
 
403 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.86 
 
 
404 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  37.1 
 
 
688 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  36.81 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.86 
 
 
404 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.86 
 
 
404 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  37.84 
 
 
466 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.13 
 
 
425 aa  262  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  38.08 
 
 
404 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  36.59 
 
 
459 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  38.33 
 
 
404 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  38.37 
 
 
417 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.12 
 
 
403 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  38.68 
 
 
449 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  37.16 
 
 
688 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  38.18 
 
 
403 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  40.5 
 
 
422 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.75 
 
 
418 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.25 
 
 
421 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  39.85 
 
 
405 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.55 
 
 
460 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  36.66 
 
 
689 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  41.74 
 
 
413 aa  257  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.26 
 
 
410 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.08 
 
 
470 aa  256  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.05 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.1 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.97 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.84 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  36.72 
 
 
690 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  36.69 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  36.91 
 
 
466 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  39.47 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  40.28 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.54 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.57 
 
 
689 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  34.63 
 
 
688 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  35.37 
 
 
687 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  37.2 
 
 
426 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.1 
 
 
469 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.62 
 
 
467 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.35 
 
 
404 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2928  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  36.93 
 
 
467 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.66 
 
 
421 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.02 
 
 
404 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.46 
 
 
404 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.32 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>