295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1096 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  73.85 
 
 		 418 aa  642    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  90.29 
 
 		 416 aa  751    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  90.53 
 
 		 416 aa  752    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  89.81 
 
 		 416 aa  750    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  74.94 
 
 		 419 aa  637    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 414 aa  831    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  73.85 
 
 		 418 aa  642    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  77.91 
 
 		 415 aa  641    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  72.22 
 
 		 414 aa  630  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  74.15 
 
 		 414 aa  628  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  63.77 
 
 		 404 aa  529  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  54.84 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  41.38 
 
 		 386 aa  298  8e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  39.08 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  38.05 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  40.14 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  38.57 
 
 		 688 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  40.05 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.86 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.86 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  38.37 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  39.86 
 
 		 445 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.41 
 
 		 418 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  39.41 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  40.86 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  39.1 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  44.66 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  37.05 
 
 		 687 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  36.17 
 
 		 688 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  38.15 
 
 		 689 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.5 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.69 
 
 		 421 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  42.69 
 
 		 469 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  36.65 
 
 		 688 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.36 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  38.15 
 
 		 689 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.14 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.78 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  36.23 
 
 		 690 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  39.56 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  35.44 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  36.41 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.2 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  39.4 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  37.65 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  34.95 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  37.41 
 
 		 404 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  34.95 
 
 		 422 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  39.22 
 
 		 422 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.67 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  38.24 
 
 		 442 aa  262  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  35.96 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.08 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.84 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  38.2 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.12 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.67 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  34.7 
 
 		 466 aa  259  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  38.44 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  35.68 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  41.21 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  35.68 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  38.73 
 
 		 747 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.76 
 
 		 460 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.76 
 
 		 460 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  35.54 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.25 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.95 
 
 		 431 aa  256  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  36.21 
 
 		 403 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  37.25 
 
 		 403 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  35.43 
 
 		 459 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  37.01 
 
 		 466 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.25 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  37.89 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  35.76 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.31 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.25 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.95 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.59 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  35.47 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.31 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.65 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  39.52 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.75 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.63 
 
 		 404 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  36.69 
 
 		 428 aa  252  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.02 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.52 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.9 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.58 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.99 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.73 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.58 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.2 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  36.76 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.74 
 
 		 410 aa  249  8e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.84 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.84 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.58 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.31 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>