284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1920 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  100 
 
 
404 aa  813    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  65.54 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  65.54 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  65.74 
 
 
416 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  65.74 
 
 
416 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  63.77 
 
 
414 aa  520  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  65.99 
 
 
416 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  61.81 
 
 
419 aa  508  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  62.08 
 
 
415 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  60.63 
 
 
414 aa  487  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  60.15 
 
 
414 aa  486  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  51.52 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  40.85 
 
 
410 aa  272  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  40 
 
 
426 aa  270  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  37.8 
 
 
386 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  37.44 
 
 
410 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  37.82 
 
 
403 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  37.56 
 
 
403 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.06 
 
 
466 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  34.77 
 
 
466 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  43.41 
 
 
469 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  42.01 
 
 
403 aa  255  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  39.85 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  37.2 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.24 
 
 
404 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  38.99 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.73 
 
 
403 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.99 
 
 
404 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.99 
 
 
404 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  38.38 
 
 
403 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  39.42 
 
 
422 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  37.68 
 
 
433 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.74 
 
 
421 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  37.78 
 
 
403 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  40.46 
 
 
422 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  36.25 
 
 
429 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.05 
 
 
410 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  39.53 
 
 
464 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.44 
 
 
423 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  37.18 
 
 
451 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  35.12 
 
 
459 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  36.82 
 
 
414 aa  245  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  43.32 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  38.07 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  34.9 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  38.07 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  39.25 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.64 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  35.94 
 
 
688 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.74 
 
 
422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.9 
 
 
410 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  37.68 
 
 
421 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  35.28 
 
 
422 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  39.8 
 
 
421 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.95 
 
 
404 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  38.38 
 
 
404 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  35.48 
 
 
688 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  42.6 
 
 
466 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  35.52 
 
 
426 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  36.71 
 
 
449 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  37.47 
 
 
417 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.77 
 
 
421 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.09 
 
 
445 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  38.29 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  34.85 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.59 
 
 
689 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.85 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.22 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  36.07 
 
 
466 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.85 
 
 
460 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  35.63 
 
 
688 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  39.71 
 
 
747 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.85 
 
 
460 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.82 
 
 
418 aa  239  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.11 
 
 
426 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.85 
 
 
460 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.07 
 
 
460 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  37.09 
 
 
445 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.34 
 
 
470 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  35.01 
 
 
460 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.69 
 
 
404 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.85 
 
 
459 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.73 
 
 
404 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  38.52 
 
 
421 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.09 
 
 
445 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  35.45 
 
 
690 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  37.81 
 
 
419 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  39.59 
 
 
404 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.24 
 
 
404 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.24 
 
 
404 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  35.8 
 
 
687 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  36.32 
 
 
428 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  36.62 
 
 
689 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.94 
 
 
404 aa  235  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.44 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.99 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.18 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.46 
 
 
410 aa  234  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.6 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>