More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1815 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  100 
 
 
414 aa  835    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  90.82 
 
 
414 aa  753    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  74.15 
 
 
414 aa  653    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  73.79 
 
 
416 aa  632  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  73.79 
 
 
416 aa  632  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  74.03 
 
 
416 aa  632  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  73.79 
 
 
415 aa  634  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  69.98 
 
 
418 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  69.98 
 
 
418 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  70.41 
 
 
419 aa  610  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  60.63 
 
 
404 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  53.35 
 
 
394 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  42.71 
 
 
386 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  38.57 
 
 
688 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  37.14 
 
 
429 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  39.81 
 
 
410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  37.38 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.95 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  39.08 
 
 
459 aa  272  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.48 
 
 
445 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  39.09 
 
 
433 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  38.48 
 
 
445 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  39.18 
 
 
410 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  37.84 
 
 
690 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  38.15 
 
 
689 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  37.92 
 
 
451 aa  269  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.97 
 
 
418 aa  269  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  38.97 
 
 
417 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  37.14 
 
 
688 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.75 
 
 
401 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  37.83 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  38.39 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  38.08 
 
 
689 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  36.89 
 
 
426 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  37.62 
 
 
688 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.9 
 
 
440 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.36 
 
 
426 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.67 
 
 
460 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  39.38 
 
 
422 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.26 
 
 
460 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  37.14 
 
 
687 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  37.29 
 
 
422 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  35.92 
 
 
422 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  37.81 
 
 
459 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.03 
 
 
460 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  38.93 
 
 
403 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.48 
 
 
459 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.03 
 
 
460 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  37.05 
 
 
459 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  38.2 
 
 
460 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.95 
 
 
466 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  36.73 
 
 
459 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.59 
 
 
439 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  43.37 
 
 
466 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.72 
 
 
460 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.17 
 
 
404 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  37.84 
 
 
408 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.89 
 
 
425 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  38.69 
 
 
403 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.69 
 
 
404 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.69 
 
 
404 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.65 
 
 
424 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.59 
 
 
410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  37.01 
 
 
428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.07 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  39.07 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.39 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  38.16 
 
 
414 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  40.62 
 
 
469 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  37.23 
 
 
747 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  37.2 
 
 
442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.24 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.24 
 
 
432 aa  253  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  35.54 
 
 
466 aa  253  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  43.69 
 
 
466 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.44 
 
 
403 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  36.05 
 
 
403 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  36.05 
 
 
403 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.99 
 
 
432 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  37.99 
 
 
421 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  38.2 
 
 
403 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  37.01 
 
 
422 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  37.02 
 
 
419 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  37.91 
 
 
422 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.53 
 
 
423 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  35.94 
 
 
404 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  38.73 
 
 
421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.97 
 
 
421 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  39.63 
 
 
404 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  35.7 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.51 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  38.7 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.16 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.52 
 
 
404 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  36.21 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.58 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  35.58 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  36.3 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.72 
 
 
467 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.24 
 
 
410 aa  242  7e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>