297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1454 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 
394 aa  789    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  55.75 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  55.75 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  54.59 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  56.81 
 
 
416 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  56.81 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  56.54 
 
 
416 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  53.35 
 
 
414 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  53.1 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  52.21 
 
 
419 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  53.12 
 
 
415 aa  413  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  51.52 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  47.39 
 
 
410 aa  355  8.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  46.56 
 
 
459 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  43.88 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  44.95 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  44.5 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  46.63 
 
 
464 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  40.81 
 
 
466 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  45.71 
 
 
408 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  42.38 
 
 
688 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  42.01 
 
 
688 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  45.26 
 
 
422 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  44.04 
 
 
433 aa  322  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  42.23 
 
 
688 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  42.23 
 
 
689 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  42.34 
 
 
689 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  42.27 
 
 
687 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.44 
 
 
470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  41.26 
 
 
466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  42.09 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.09 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.09 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  42.08 
 
 
459 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.45 
 
 
466 aa  319  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.39 
 
 
459 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  45.32 
 
 
469 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  41.18 
 
 
459 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.39 
 
 
460 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.39 
 
 
460 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.08 
 
 
460 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.61 
 
 
401 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  42.23 
 
 
417 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  43.41 
 
 
426 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  41.48 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  41.92 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.35 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  43.22 
 
 
747 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.82 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  43.29 
 
 
403 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.76 
 
 
460 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.54 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  41.62 
 
 
429 aa  312  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.29 
 
 
404 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.29 
 
 
404 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  43.46 
 
 
414 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  41.04 
 
 
690 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.65 
 
 
469 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.5 
 
 
410 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  40.36 
 
 
466 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.67 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.67 
 
 
471 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3205  Cytochrome b/b6 domain  41.11 
 
 
466 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2858  Cytochrome b/b6 domain protein  41.11 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702367  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  41.46 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2928  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  41.12 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  41.21 
 
 
404 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  39.8 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.32 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  42.5 
 
 
403 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.78 
 
 
472 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  41.48 
 
 
445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.78 
 
 
467 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.48 
 
 
445 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.2 
 
 
421 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  42.68 
 
 
428 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  40.92 
 
 
422 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.76 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.46 
 
 
473 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.36 
 
 
425 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.53 
 
 
403 aa  301  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  41.46 
 
 
473 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  41.52 
 
 
449 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  42.93 
 
 
405 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  40.51 
 
 
403 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  40.76 
 
 
403 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  42.64 
 
 
409 aa  299  5e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  42.28 
 
 
403 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  41.12 
 
 
422 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.65 
 
 
410 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  43.52 
 
 
408 aa  295  9e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  43.38 
 
 
408 aa  294  2e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  41.12 
 
 
426 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.44 
 
 
440 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>