88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2129 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  100 
 
 		 255 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  92.09 
 
 		 254 aa  487  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  78.04 
 
 		 255 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  76.86 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  77.25 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  77.25 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  76.86 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  77.25 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  77.25 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  76.47 
 
 		 255 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  76.86 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  76.86 
 
 		 255 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  75.69 
 
 		 255 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  29.96 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2956  cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  29.69 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.79 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  48.48 
 
 		 110 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2710  hypothetical protein  33.93 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  30.47 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  34.48 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.96 
 
 		 488 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  35.25 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  34.96 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 111 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  30.71 
 
 		 394 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  31.58 
 
 		 426 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2120  hypothetical protein  27.78 
 
 		 173 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  35.44 
 
 		 464 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 329 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  34.15 
 
 		 575 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  32.76 
 
 		 451 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 120 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  31.06 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  34.51 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  35.85 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  52.17 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  29.11 
 
 		 445 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  32.76 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  32.33 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  32.84 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1136  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.08 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.392758  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  31.9 
 
 		 451 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.11 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  52.17 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  52.17 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 548 aa  46.2  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.93 
 
 		 445 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  28.48 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3096  cytochrome b(C-terminal)/b6  27.91 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.81 
 
 		 367 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  31.85 
 
 		 419 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.95 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2348  cytochrome b6-f complex subunit IV  28.78 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  50 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  32.81 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  51.16 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  50 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  35.07 
 
 		 431 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  32.35 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  32.35 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  51.16 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21841  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.3 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  26.71 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  51.16 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  50 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  25.61 
 
 		 731 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  30.53 
 
 		 160 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1702  cytb6/f complex subunit IV  29.77 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  41.27 
 
 		 107 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  28.57 
 
 		 414 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  33.59 
 
 		 421 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  29.77 
 
 		 414 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3442  cytochrome b6-f complex subunit IV  31.67 
 
 		 160 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00315732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  30.83 
 
 		 160 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  30.83 
 
 		 160 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  31.39 
 
 		 414 aa  42  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  39.68 
 
 		 107 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  30 
 
 		 307 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  39.68 
 
 		 107 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  39.68 
 
 		 107 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  39.68 
 
 		 107 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  39.68 
 
 		 107 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 330 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>