75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0648 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  65.57 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3096  cytochrome b(C-terminal)/b6  64.31 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  31.34 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  28.24 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  33.33 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  30.06 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  30.06 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  28.86 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  29.21 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  28.92 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  29.41 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  28.92 
 
 		 559 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.35 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3442  cytochrome b6-f complex subunit IV  32.48 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00315732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  28.29 
 
 		 580 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2348  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.1 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1702  cytb6/f complex subunit IV  31.21 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03621  cytochrome b6-f complex subunit IV  28.57 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  27.41 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.49 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  28.31 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  26.67 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  26.45 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03521  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.45 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03501  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.45 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  30.47 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.08 
 
 		 445 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1136  cytochrome b6-f complex subunit IV  29.3 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.392758  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04181  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.81 
 
 		 160 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03581  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.45 
 
 		 160 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.170211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  26.47 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1703  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.81 
 
 		 160 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0486  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.35 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.625856  normal  0.541089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  29.36 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  25.29 
 
 		 449 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.04 
 
 		 445 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  27.92 
 
 		 522 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0332  cytochrome b6-f complex subunit IV  25.81 
 
 		 160 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  29.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  25.52 
 
 		 445 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21841  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.45 
 
 		 160 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  30.19 
 
 		 451 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  25.63 
 
 		 551 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1848  cytochrome b6-f complex subunit IV  26.7 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.342788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  22.73 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32458  predicted protein  25 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658083  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.7 
 
 		 440 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  26.62 
 
 		 566 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  26.11 
 
 		 690 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  27.78 
 
 		 416 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  27.78 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  27.78 
 
 		 416 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2956  cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  22.5 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  31.21 
 
 		 583 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  24.4 
 
 		 547 aa  45.4  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  26.95 
 
 		 688 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  25.53 
 
 		 689 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  26.32 
 
 		 555 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  23.74 
 
 		 561 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  32.22 
 
 		 414 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  26.28 
 
 		 442 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  26.87 
 
 		 543 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  27.13 
 
 		 688 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  26.6 
 
 		 575 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>