185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0207 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  100 
 
 
131 aa  256  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  37.17 
 
 
367 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  44.12 
 
 
367 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  40.91 
 
 
367 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  31.01 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  31.91 
 
 
262 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  33.07 
 
 
417 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  34.35 
 
 
367 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  30.6 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.96 
 
 
424 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.29 
 
 
367 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  31.33 
 
 
451 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  31.54 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  30.67 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.54 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.4 
 
 
425 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.96 
 
 
439 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.54 
 
 
562 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.08 
 
 
440 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.53 
 
 
445 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3096  cytochrome b(C-terminal)/b6  31.85 
 
 
255 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.29 
 
 
428 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  31.39 
 
 
472 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  37.38 
 
 
688 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  31.5 
 
 
688 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  32.31 
 
 
442 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  35.71 
 
 
428 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  35.2 
 
 
430 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  34.26 
 
 
690 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.2 
 
 
430 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  36.7 
 
 
430 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  32.2 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  32.2 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.31 
 
 
418 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  38.89 
 
 
405 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.61 
 
 
410 aa  60.1  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  34.23 
 
 
689 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  33.83 
 
 
417 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  33.05 
 
 
687 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.96 
 
 
420 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  33.33 
 
 
404 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  30.94 
 
 
418 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  30.94 
 
 
418 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  30.36 
 
 
426 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.91 
 
 
416 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  32.35 
 
 
429 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.91 
 
 
416 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.91 
 
 
416 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  33.96 
 
 
409 aa  57.8  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  32.41 
 
 
688 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.77 
 
 
421 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  32.77 
 
 
421 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  34.35 
 
 
426 aa  57  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  33.04 
 
 
422 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.3 
 
 
404 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  32.48 
 
 
422 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  35.96 
 
 
422 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  32.84 
 
 
428 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.48 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.3 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.21 
 
 
421 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.43 
 
 
404 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  31.62 
 
 
426 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  32.43 
 
 
689 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  33.02 
 
 
408 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  31.4 
 
 
404 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  33.94 
 
 
422 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.62 
 
 
404 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32458  predicted protein  40 
 
 
213 aa  55.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658083  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  33.94 
 
 
421 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  27.52 
 
 
488 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  29.86 
 
 
410 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  40.51 
 
 
404 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  33.05 
 
 
428 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.62 
 
 
404 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.62 
 
 
404 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  35.58 
 
 
451 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.66 
 
 
404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  30.71 
 
 
414 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  32.08 
 
 
408 aa  54.7  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.58 
 
 
429 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  34.21 
 
 
421 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.17 
 
 
404 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  27.01 
 
 
419 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  29.06 
 
 
404 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.06 
 
 
404 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.93 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  33.59 
 
 
408 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.81 
 
 
404 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.43 
 
 
426 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.81 
 
 
404 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  32.82 
 
 
422 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  36.73 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  36.73 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03621  cytochrome b6-f complex subunit IV  33.98 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.582843  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  32.69 
 
 
451 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  34.78 
 
 
413 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.66 
 
 
404 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  32.69 
 
 
451 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03521  cytochrome b6-f complex subunit IV  37.65 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>