More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1779 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  100 
 
 		 422 aa  844    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  76.2 
 
 		 431 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  81.72 
 
 		 426 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  79.17 
 
 		 431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  75 
 
 		 421 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  80 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  79.89 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  40.23 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  39.39 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  37.5 
 
 		 367 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.77 
 
 		 367 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  37.5 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  34.56 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  30.95 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  33.63 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  38.46 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  38.46 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  38.39 
 
 		 218 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  38.39 
 
 		 218 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  37.44 
 
 		 218 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  39.37 
 
 		 222 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  39.34 
 
 		 218 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  39.34 
 
 		 218 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  38.86 
 
 		 218 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  37.9 
 
 		 218 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  37.44 
 
 		 218 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  37.44 
 
 		 218 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.76 
 
 		 215 aa  176  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  38.01 
 
 		 222 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  40.28 
 
 		 215 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  37.44 
 
 		 218 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.85 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  37.91 
 
 		 215 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  34.88 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  37.1 
 
 		 222 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  38.57 
 
 		 224 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  31.64 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  32.09 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  32.63 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  39.46 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  38.12 
 
 		 224 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  33.14 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  31.64 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.95 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.02 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.02 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.49 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.45 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  33.02 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  30.62 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  33.52 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  31.4 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  32.95 
 
 		 394 aa  162  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.45 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.45 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.77 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  30.35 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.63 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.77 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  38.79 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  35.11 
 
 		 268 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  29.2 
 
 		 747 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  31.07 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  28.95 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  31.33 
 
 		 466 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  30.79 
 
 		 408 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.23 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.65 
 
 		 562 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  30.09 
 
 		 688 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  33.12 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  30.33 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.91 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  30.33 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  28.61 
 
 		 688 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.4 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  29.78 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  29.79 
 
 		 690 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  30.39 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.39 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  31.08 
 
 		 689 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  29.5 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  29.5 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  31.9 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>