More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1649 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  100 
 
 		 367 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  81.74 
 
 		 367 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  76.02 
 
 		 367 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  71.12 
 
 		 367 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  71.93 
 
 		 367 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  40.7 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  39.66 
 
 		 687 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  41 
 
 		 394 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  40.59 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  39.51 
 
 		 469 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  38.42 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.39 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  40 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  38.94 
 
 		 688 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.02 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  40.76 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.82 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  39.17 
 
 		 688 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  36.9 
 
 		 690 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  37.36 
 
 		 689 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.7 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.57 
 
 		 410 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  40.43 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  39.17 
 
 		 688 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  37.7 
 
 		 426 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.99 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  36.99 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  39.21 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  37.57 
 
 		 418 aa  238  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  37.57 
 
 		 418 aa  238  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  37.28 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  36.65 
 
 		 689 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.38 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  37.28 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  36.42 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.28 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  38.57 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  38.76 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  36.42 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  37.5 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  38.76 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.87 
 
 		 467 aa  233  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.88 
 
 		 470 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  37.36 
 
 		 408 aa  232  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  39.22 
 
 		 410 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  40.45 
 
 		 459 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.84 
 
 		 418 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  39.82 
 
 		 459 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.42 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  40.06 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.46 
 
 		 469 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.35 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  36.36 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.3 
 
 		 409 aa  229  8e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  36.36 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  36.1 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.77 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.9 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  36.21 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  38.62 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  36.12 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  40.43 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.8 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  40.45 
 
 		 466 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  38.04 
 
 		 422 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  37.08 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  36.56 
 
 		 421 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.08 
 
 		 404 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.08 
 
 		 404 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  36.98 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.58 
 
 		 460 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.63 
 
 		 421 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  38.58 
 
 		 460 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  39.87 
 
 		 459 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.89 
 
 		 460 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.51 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.25 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.38 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  39.6 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.84 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  35.91 
 
 		 747 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  38.14 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  38.89 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.84 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.12 
 
 		 423 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  37.64 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  40 
 
 		 478 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  37.84 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.84 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.05 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  35.85 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  34.52 
 
 		 459 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  36.22 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40 
 
 		 460 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  35.96 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.73 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>