289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1333 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 488 aa  974    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  63.66 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  63.91 
 
 		 472 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  36.38 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  37.86 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.19 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  36.26 
 
 		 557 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  35.1 
 
 		 566 aa  275  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  39.52 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  36.84 
 
 		 580 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  35.08 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  36.15 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.28 
 
 		 546 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  34.91 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  36.26 
 
 		 575 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  39.85 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  36.43 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  37.08 
 
 		 553 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  35.76 
 
 		 561 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.91 
 
 		 582 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  35.67 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.41 
 
 		 568 aa  249  7e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.09 
 
 		 536 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  34.79 
 
 		 564 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  34.59 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  32.54 
 
 		 583 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  36.94 
 
 		 535 aa  246  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.87 
 
 		 536 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  36.32 
 
 		 551 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  32.65 
 
 		 541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.82 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  34.37 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  33.57 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.08 
 
 		 557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.52 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  34.14 
 
 		 564 aa  232  9e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  32.1 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.96 
 
 		 549 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  31.36 
 
 		 542 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  33.8 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  34.78 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  35.29 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.46 
 
 		 558 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  35.46 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.46 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.67 
 
 		 542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  34.7 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  32.48 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  36.4 
 
 		 269 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  32.48 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  32.48 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  39.79 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.89 
 
 		 448 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  27.05 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  32.92 
 
 		 267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  34.08 
 
 		 218 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  33.04 
 
 		 218 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  31.88 
 
 		 218 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  31.72 
 
 		 218 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  31.72 
 
 		 218 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  34.23 
 
 		 222 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  34.23 
 
 		 222 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  31.72 
 
 		 218 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  32.74 
 
 		 218 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  32.29 
 
 		 218 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  32.29 
 
 		 218 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  28.02 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  32.14 
 
 		 222 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  32.89 
 
 		 215 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  33.48 
 
 		 224 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  32.89 
 
 		 222 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  33.05 
 
 		 224 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  31 
 
 		 218 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.78 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.48 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.81 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  32.59 
 
 		 215 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  31.76 
 
 		 224 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  36.6 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.01 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  31.47 
 
 		 268 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  34.62 
 
 		 249 aa  123  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  27.59 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  30.72 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  27.59 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  32.29 
 
 		 222 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  27.54 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  31.78 
 
 		 257 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.11 
 
 		 562 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  28.06 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>