116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2332 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2332  cytochrome b6-f complex subunit IV  100 
 
 		 160 aa  317  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.521824 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21841  cytochrome b6-f complex subunit IV  84.38 
 
 		 160 aa  278  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2577  cytochrome b6-f complex subunit IV  85.62 
 
 		 160 aa  276  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3537  cytochrome b6-f complex subunit IV  85.62 
 
 		 160 aa  276  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1848  cytochrome b6-f complex subunit IV  82.5 
 
 		 160 aa  276  8e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.342788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03501  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.75 
 
 		 160 aa  276  8e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03521  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.75 
 
 		 160 aa  276  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0486  cytochrome b6-f complex subunit IV  82.5 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.625856  normal  0.541089 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0332  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.12 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03581  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.12 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.170211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1136  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.75 
 
 		 160 aa  274  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.392758  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03621  cytochrome b6-f complex subunit IV  83.12 
 
 		 160 aa  274  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1703  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.25 
 
 		 160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04181  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.25 
 
 		 160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3442  cytochrome b6-f complex subunit IV  78.75 
 
 		 160 aa  267  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00315732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1702  cytb6/f complex subunit IV  78.12 
 
 		 160 aa  266  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2348  cytochrome b6-f complex subunit IV  81.13 
 
 		 161 aa  266  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2252  cytochrome b6-f complex subunit IV  80.62 
 
 		 160 aa  266  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000291969 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32458  predicted protein  71.07 
 
 		 213 aa  251  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658083  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  32.88 
 
 		 367 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  39.51 
 
 		 367 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.33 
 
 		 439 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  36.47 
 
 		 367 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  36.47 
 
 		 367 aa  57.4  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  35.85 
 
 		 688 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.55 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  38.46 
 
 		 690 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  34.62 
 
 		 689 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  34.62 
 
 		 689 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  35.87 
 
 		 688 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  28.31 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  28.95 
 
 		 421 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  39.53 
 
 		 688 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.77 
 
 		 408 aa  53.9  0.0000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  34.83 
 
 		 405 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.79 
 
 		 425 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  28.97 
 
 		 421 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0577  cytochrome b(C-terminal)/b6  28.16 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305538  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  34.07 
 
 		 404 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  34.07 
 
 		 404 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  39.02 
 
 		 403 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  38.37 
 
 		 687 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  28.95 
 
 		 421 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.14 
 
 		 367 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.04 
 
 		 430 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  34.04 
 
 		 430 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  34.04 
 
 		 430 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  50 
 
 		 408 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  53.66 
 
 		 400 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  26.16 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.38 
 
 		 420 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  35.37 
 
 		 428 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  40 
 
 		 459 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.82 
 
 		 424 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  40 
 
 		 410 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.94 
 
 		 418 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.51 
 
 		 403 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  40.38 
 
 		 403 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  30.53 
 
 		 404 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  31.91 
 
 		 426 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.61 
 
 		 404 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.29 
 
 		 404 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.29 
 
 		 404 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.44 
 
 		 428 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  30.61 
 
 		 404 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  60 
 
 		 408 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  38.18 
 
 		 404 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  35.63 
 
 		 428 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.85 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.53 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  36.27 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  30.53 
 
 		 409 aa  45.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.63 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.63 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.11 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.87 
 
 		 404 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  28.57 
 
 		 421 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  37.5 
 
 		 421 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  36.17 
 
 		 410 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.47 
 
 		 404 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  31.97 
 
 		 472 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  31.11 
 
 		 404 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  40.38 
 
 		 403 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  38.27 
 
 		 426 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  37.74 
 
 		 403 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.74 
 
 		 404 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.74 
 
 		 404 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.74 
 
 		 404 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  43.14 
 
 		 423 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  40.38 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  40.38 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  29.03 
 
 		 429 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  44.23 
 
 		 413 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  29.69 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3096  cytochrome b(C-terminal)/b6  24.05 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  32.65 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  34.29 
 
 		 417 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>