285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0319 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  100 
 
 
437 aa  878    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.62 
 
 
429 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  44.8 
 
 
425 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  36.94 
 
 
488 aa  272  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  35.28 
 
 
472 aa  269  8.999999999999999e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  35.12 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  33.48 
 
 
566 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  34.45 
 
 
575 aa  242  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  35.88 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  32.73 
 
 
543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  35.75 
 
 
545 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  34.45 
 
 
557 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  32.28 
 
 
559 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  34.68 
 
 
580 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  31.82 
 
 
547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.22 
 
 
568 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.4 
 
 
532 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  32.37 
 
 
583 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  33.12 
 
 
561 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  35.27 
 
 
551 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  32.9 
 
 
556 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.17 
 
 
582 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  34.01 
 
 
539 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  36.34 
 
 
545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  34.8 
 
 
527 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.37 
 
 
546 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  35.2 
 
 
564 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  33.56 
 
 
537 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  36.16 
 
 
548 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  36.3 
 
 
555 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.31 
 
 
557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.31 
 
 
536 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  32.25 
 
 
542 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  32.51 
 
 
564 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  33.49 
 
 
553 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.31 
 
 
536 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.31 
 
 
549 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  32.44 
 
 
581 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  35.7 
 
 
549 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  35.79 
 
 
535 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  33.79 
 
 
553 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.76 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  35.44 
 
 
558 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.44 
 
 
558 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  32.49 
 
 
541 aa  199  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.21 
 
 
558 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  33.41 
 
 
551 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  33.04 
 
 
222 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  32.16 
 
 
222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  32.16 
 
 
222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  30.97 
 
 
222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  35.86 
 
 
267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  32.93 
 
 
267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  30.09 
 
 
218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  32.11 
 
 
269 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  30.09 
 
 
218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  30.4 
 
 
218 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  30.4 
 
 
218 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  30.84 
 
 
218 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  30.4 
 
 
218 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  29.96 
 
 
218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  29.96 
 
 
218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  25.82 
 
 
367 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  31.72 
 
 
215 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  30.4 
 
 
218 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.16 
 
 
215 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  30.4 
 
 
218 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  30.84 
 
 
215 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  30.97 
 
 
222 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.74 
 
 
488 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 
268 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  27.52 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  26.91 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  26.38 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  30.93 
 
 
224 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  30.93 
 
 
224 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  32.02 
 
 
249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.84 
 
 
562 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  24.56 
 
 
367 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.02 
 
 
367 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  27.69 
 
 
451 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  29.66 
 
 
224 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  27.69 
 
 
451 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  27.69 
 
 
451 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  28.7 
 
 
410 aa  106  7e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  25.32 
 
 
367 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  28.19 
 
 
429 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  25.78 
 
 
747 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  24.11 
 
 
410 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.84 
 
 
425 aa  103  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>