295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0500 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  68.88 
 
 		 536 aa  729    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 548 aa  1094    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.58 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  43.45 
 
 		 557 aa  382  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.67 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.92 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  32.32 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.97 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  29.55 
 
 		 367 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  30.37 
 
 		 367 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  30.63 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  29.55 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.97 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  29.55 
 
 		 690 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  28.89 
 
 		 689 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  28.86 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  28.46 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.33 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  28.11 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  28.89 
 
 		 689 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  28.69 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.41 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  28.41 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.07 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.41 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  26.61 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  28.41 
 
 		 688 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  27.39 
 
 		 426 aa  107  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  28.12 
 
 		 687 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  26.72 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.81 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  28.41 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.45 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  28.8 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.93 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.74 
 
 		 439 aa  104  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  28.23 
 
 		 421 aa  104  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  26.25 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.21 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  30.95 
 
 		 215 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  28.43 
 
 		 410 aa  101  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.61 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  30.77 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  30 
 
 		 222 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.06 
 
 		 215 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  32.97 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  31.58 
 
 		 215 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  29.44 
 
 		 218 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  29.44 
 
 		 218 aa  98.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  29.44 
 
 		 218 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  25.52 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  25.68 
 
 		 426 aa  98.2  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.66 
 
 		 562 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.61 
 
 		 401 aa  97.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  29.44 
 
 		 218 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.78 
 
 		 531 aa  97.8  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000370205 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  26.46 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  31.6 
 
 		 268 aa  97.4  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  27.84 
 
 		 417 aa  97.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  28.97 
 
 		 218 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  28.62 
 
 		 442 aa  97.1  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  28.97 
 
 		 218 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  28.97 
 
 		 218 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  27.92 
 
 		 575 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  28.97 
 
 		 218 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  25.79 
 
 		 422 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  28.97 
 
 		 218 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  26.49 
 
 		 428 aa  96.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  27.42 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  27.84 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  26.98 
 
 		 422 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  26.69 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.27 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.12 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  29.36 
 
 		 416 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  30.09 
 
 		 222 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  27.16 
 
 		 426 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.21 
 
 		 421 aa  94.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  28.21 
 
 		 414 aa  94.4  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  28.5 
 
 		 218 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  29.09 
 
 		 416 aa  94  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  29.09 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.71 
 
 		 472 aa  93.6  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  29.41 
 
 		 224 aa  93.6  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  26.46 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  26.73 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  28.96 
 
 		 224 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  28.01 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  31.64 
 
 		 429 aa  92.8  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  28.01 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>