280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1939 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1013    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.25 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  48.12 
 
 		 536 aa  334  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.1 
 
 		 548 aa  326  5e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.83 
 
 		 562 aa  303  6.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  44.83 
 
 		 557 aa  271  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.45 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  33.68 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  29.64 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  29.79 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.16 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  30.18 
 
 		 690 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  30.23 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.01 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.88 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  29.52 
 
 		 215 aa  97.1  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  29.58 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  27.91 
 
 		 222 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  27.75 
 
 		 215 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  29.13 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.23 
 
 		 215 aa  95.1  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.12 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  28.42 
 
 		 689 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  28.46 
 
 		 367 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  28.18 
 
 		 222 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  26.74 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  26.92 
 
 		 218 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  27.27 
 
 		 218 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  26.92 
 
 		 218 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  28.18 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  27.27 
 
 		 218 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  27.27 
 
 		 218 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  27.27 
 
 		 218 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  29.02 
 
 		 429 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  26.92 
 
 		 218 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  27.4 
 
 		 218 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  29.95 
 
 		 224 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.23 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  28.06 
 
 		 688 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  30.23 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  27.95 
 
 		 417 aa  90.5  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  28.23 
 
 		 442 aa  90.5  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  25.96 
 
 		 416 aa  90.5  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  28.46 
 
 		 688 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.91 
 
 		 430 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  27.91 
 
 		 430 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  28.88 
 
 		 428 aa  90.1  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  25.96 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  25.96 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.42 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  26.92 
 
 		 218 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.06 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  27.94 
 
 		 689 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  26.81 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  28.86 
 
 		 410 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  26.92 
 
 		 218 aa  89.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.37 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  30.37 
 
 		 224 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  26.44 
 
 		 222 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  32.41 
 
 		 268 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  26.44 
 
 		 222 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  29.91 
 
 		 224 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  26.6 
 
 		 414 aa  87.8  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  27.44 
 
 		 367 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  27.91 
 
 		 688 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  28.42 
 
 		 687 aa  86.7  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  27.14 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  27.14 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  27.04 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  27.67 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  26.25 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  27.41 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.25 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.24 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  25.54 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  32.24 
 
 		 206 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.78 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  26.13 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  25.5 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  24.27 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  25.31 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.87 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  25.45 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.17 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  27.08 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.59 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  25.68 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  27.98 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.48 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.55 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>