280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1912 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  929    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.25 
 
 		 514 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  42.56 
 
 		 536 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  45.41 
 
 		 548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.24 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  43.88 
 
 		 557 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  28.18 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.09 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  27.3 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.4 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  28.12 
 
 		 367 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  25.42 
 
 		 464 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  28.41 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.92 
 
 		 410 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  32.21 
 
 		 224 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  32.95 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  31.73 
 
 		 224 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.45 
 
 		 367 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  23.65 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  26.83 
 
 		 689 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  31.58 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.88 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  28.99 
 
 		 575 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  26.63 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  26.63 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  27.07 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.24 
 
 		 562 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  26.35 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  29.86 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  26.51 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  26.99 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  29.86 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  27.33 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.5 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  27.3 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  28.85 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  29.86 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  29.86 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  32.12 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  23.2 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  36.02 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  28 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  27.23 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  29.38 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  25.5 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  27.24 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  25.8 
 
 		 688 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  26.36 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  29.71 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  26.23 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  31.61 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  26.59 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.58 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  37.33 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  34.62 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  25.97 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.59 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.76 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  36.15 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  34.62 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.62 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.04 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  35.38 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  24.93 
 
 		 687 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  26.04 
 
 		 553 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  28.29 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  31.09 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  30.57 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.71 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  26.92 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  29.9 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  26.33 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  25.61 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  30.57 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.3 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  25.59 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  26.82 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.61 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  28.91 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  26.44 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.92 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  26.46 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  31.61 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  28.91 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  24.92 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.96 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000370205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  26.6 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>