283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3105 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  100 
 
 		 527 aa  1067    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  83.87 
 
 		 546 aa  912    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  63.02 
 
 		 536 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  61.56 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  64.1 
 
 		 536 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  59.43 
 
 		 564 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  57.09 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  61.35 
 
 		 532 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  59.27 
 
 		 535 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  60.22 
 
 		 549 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  57.51 
 
 		 539 aa  568  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.91 
 
 		 568 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  58.49 
 
 		 555 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.4 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  57.05 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.9 
 
 		 549 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.08 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  55.77 
 
 		 545 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  56.95 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  58.87 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.87 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  58.58 
 
 		 542 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  53.27 
 
 		 543 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  55.34 
 
 		 545 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  52.19 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.12 
 
 		 582 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  49.71 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.81 
 
 		 542 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  51.31 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  50 
 
 		 559 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  53.42 
 
 		 580 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  53.25 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  48.78 
 
 		 575 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  51.98 
 
 		 583 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  46.05 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  52.46 
 
 		 548 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  45.27 
 
 		 581 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  50.1 
 
 		 551 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  48.55 
 
 		 547 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  47.87 
 
 		 564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  49 
 
 		 551 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  36.54 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  35.54 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  33.8 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  33.64 
 
 		 425 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.64 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  34.8 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  32.88 
 
 		 269 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  34.07 
 
 		 267 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  32.1 
 
 		 268 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.81 
 
 		 488 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  30.22 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  27.75 
 
 		 224 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  30.41 
 
 		 222 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  27.31 
 
 		 224 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  29.72 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  30.19 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  29.25 
 
 		 218 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  29.25 
 
 		 218 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  29.58 
 
 		 433 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.72 
 
 		 215 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  32.45 
 
 		 247 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  28.31 
 
 		 215 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  27.01 
 
 		 466 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  29.44 
 
 		 222 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  29.44 
 
 		 222 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  28.77 
 
 		 218 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  26.43 
 
 		 224 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  27.64 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  28.11 
 
 		 222 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  28.77 
 
 		 218 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  31.13 
 
 		 218 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  28.77 
 
 		 218 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  31.25 
 
 		 206 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  30.66 
 
 		 218 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  29.63 
 
 		 222 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  28.3 
 
 		 218 aa  100  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  26.29 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  28.3 
 
 		 218 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  27.69 
 
 		 413 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.62 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  31.07 
 
 		 206 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  26.07 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  29.91 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  28.03 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  25.88 
 
 		 466 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  27.3 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.09 
 
 		 410 aa  94  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  30.53 
 
 		 422 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>