284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3137 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  56.33 
 
 
543 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 
582 aa  1187    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  56.04 
 
 
583 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  57.17 
 
 
580 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  54.26 
 
 
566 aa  621  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  57.09 
 
 
557 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  55.61 
 
 
561 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  54.17 
 
 
556 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  54.02 
 
 
564 aa  608  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  55.82 
 
 
575 aa  608  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  54.72 
 
 
553 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  55.17 
 
 
581 aa  601  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  49.37 
 
 
559 aa  579  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  54.83 
 
 
547 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  52.23 
 
 
545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.53 
 
 
546 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  51.59 
 
 
545 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.21 
 
 
568 aa  545  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.93 
 
 
542 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  54.12 
 
 
527 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  49.91 
 
 
551 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  47.31 
 
 
539 aa  512  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  47.71 
 
 
541 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  51.29 
 
 
548 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.53 
 
 
557 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  53.77 
 
 
551 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  48.32 
 
 
553 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  51.13 
 
 
564 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  51.92 
 
 
549 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  46.62 
 
 
537 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.46 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  55.46 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.46 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.64 
 
 
536 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.09 
 
 
536 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  49.36 
 
 
549 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.5 
 
 
532 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  51.79 
 
 
555 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  50.59 
 
 
542 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  46.12 
 
 
522 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  50.52 
 
 
535 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  37.53 
 
 
464 aa  273  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  35.75 
 
 
472 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  36.41 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.57 
 
 
429 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  34.94 
 
 
425 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  34.94 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.29 
 
 
488 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  35.02 
 
 
268 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  35.29 
 
 
269 aa  125  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  29.7 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  32.72 
 
 
218 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  30.97 
 
 
224 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.72 
 
 
215 aa  121  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  31.34 
 
 
218 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  31.34 
 
 
218 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  32.26 
 
 
215 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  28.84 
 
 
367 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  30.53 
 
 
224 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  30.09 
 
 
224 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  31.34 
 
 
215 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  31.34 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  32.57 
 
 
222 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  29.91 
 
 
218 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  29.91 
 
 
218 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  30.73 
 
 
222 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  31.19 
 
 
222 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  31.19 
 
 
222 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  29.91 
 
 
218 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  29.33 
 
 
218 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  31.8 
 
 
218 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  31.8 
 
 
218 aa  117  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  33.69 
 
 
267 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  33.16 
 
 
267 aa  114  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  30.91 
 
 
222 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  30.13 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.42 
 
 
367 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  28.78 
 
 
433 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  27.36 
 
 
413 aa  110  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  28.62 
 
 
422 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  26.97 
 
 
422 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  28.16 
 
 
466 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  27.55 
 
 
575 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  27.51 
 
 
466 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  32.66 
 
 
206 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.81 
 
 
466 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  33.71 
 
 
247 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  28.79 
 
 
410 aa  104  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  29.75 
 
 
414 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  27.02 
 
 
469 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>