284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4024 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  95.15 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0458  cytochrome b/b6 domain-containing protein  75.24 
 
 		 206 aa  304  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  68.93 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0539  cytochrome b/b6-like  70.87 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  64.56 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.95 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  43.59 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.18 
 
 		 562 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  37 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  36.5 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  37.98 
 
 		 451 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  37.98 
 
 		 451 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  39.55 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  37.5 
 
 		 451 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.46 
 
 		 448 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  38.98 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  39.55 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  38.98 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  38.98 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  38.07 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  34.3 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.3 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  40.5 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  35.92 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  35.92 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  38.42 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  39.77 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  35.57 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  39.66 
 
 		 269 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  36.52 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  38.07 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  34.59 
 
 		 422 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  36.17 
 
 		 431 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  34.43 
 
 		 575 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  35.96 
 
 		 425 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  32.86 
 
 		 557 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  34.6 
 
 		 583 aa  111  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  32.09 
 
 		 488 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  30.73 
 
 		 556 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.78 
 
 		 429 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  37.62 
 
 		 545 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.88 
 
 		 431 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  36.22 
 
 		 426 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  35.38 
 
 		 464 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  31.68 
 
 		 581 aa  107  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  33.49 
 
 		 580 aa  107  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.8 
 
 		 546 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  34.05 
 
 		 575 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  32.09 
 
 		 472 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  35.93 
 
 		 429 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.31 
 
 		 367 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  37.57 
 
 		 421 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  29.59 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  33.33 
 
 		 566 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 		 547 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  32.57 
 
 		 564 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  36.88 
 
 		 249 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  34.53 
 
 		 549 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  31.82 
 
 		 367 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.18 
 
 		 470 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  36.08 
 
 		 510 aa  104  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  34.4 
 
 		 537 aa  104  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  34.73 
 
 		 429 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  32.18 
 
 		 466 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  37.27 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  34.36 
 
 		 400 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  31.31 
 
 		 418 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  31.31 
 
 		 418 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  29.52 
 
 		 561 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  31.61 
 
 		 466 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  32.2 
 
 		 466 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.3 
 
 		 473 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  28.72 
 
 		 469 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.84 
 
 		 416 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  29.89 
 
 		 403 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  34.25 
 
 		 367 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  31.25 
 
 		 527 aa  101  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  30.48 
 
 		 522 aa  101  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  29.89 
 
 		 413 aa  101  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  32.3 
 
 		 473 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.84 
 
 		 416 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.84 
 
 		 416 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>