283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0539 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0539  cytochrome b/b6-like  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  87.86 
 
 		 206 aa  363  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  70.87 
 
 		 206 aa  298  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  69.9 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0458  cytochrome b/b6 domain-containing protein  69.9 
 
 		 206 aa  284  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  66.02 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.33 
 
 		 251 aa  157  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  41.33 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  36.45 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  39.89 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.67 
 
 		 562 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  37.32 
 
 		 451 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  37.32 
 
 		 451 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  39.2 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  36.84 
 
 		 451 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  43.33 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.62 
 
 		 448 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  36.11 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  39.33 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  35.56 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  35.56 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  35.56 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  35.56 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  35.56 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  36.11 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  36.11 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  35.56 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  36.11 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  35 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  35.56 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  38.33 
 
 		 249 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  35 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  35 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  35 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  35.33 
 
 		 575 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  34.24 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.24 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  35.92 
 
 		 425 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  33.52 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  34.09 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  35.03 
 
 		 401 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  35.03 
 
 		 401 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  33.9 
 
 		 410 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  36.81 
 
 		 422 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  34.01 
 
 		 426 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  35.03 
 
 		 466 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  36.11 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  34.46 
 
 		 464 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.6 
 
 		 431 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.46 
 
 		 470 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.9 
 
 		 410 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  38.01 
 
 		 421 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  32.83 
 
 		 394 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.9 
 
 		 466 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.91 
 
 		 410 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  33.33 
 
 		 459 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  33.9 
 
 		 466 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  33.33 
 
 		 459 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  33.9 
 
 		 466 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.98 
 
 		 410 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  33.9 
 
 		 459 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  36.25 
 
 		 426 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.9 
 
 		 460 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  33.9 
 
 		 460 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.9 
 
 		 460 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.51 
 
 		 403 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  34.46 
 
 		 469 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  34.34 
 
 		 367 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.15 
 
 		 473 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.76 
 
 		 472 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  35.9 
 
 		 400 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  37.87 
 
 		 429 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  33.71 
 
 		 413 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.97 
 
 		 429 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  31.98 
 
 		 433 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  33.33 
 
 		 421 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  35.59 
 
 		 403 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  33.7 
 
 		 422 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  34.15 
 
 		 473 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  34.64 
 
 		 431 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  32.02 
 
 		 478 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  33.15 
 
 		 403 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  33.33 
 
 		 422 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  37.31 
 
 		 510 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>