283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0458 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0458  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  75.24 
 
 		 206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  75.24 
 
 		 206 aa  316  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  70.39 
 
 		 206 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  67.48 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0539  cytochrome b/b6-like  69.9 
 
 		 206 aa  254  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.53 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  45.18 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  38.94 
 
 		 451 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.67 
 
 		 448 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  38.94 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  38.46 
 
 		 451 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.98 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  38.07 
 
 		 267 aa  121  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  33.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  35.11 
 
 		 268 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  34.46 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  34.46 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  34.46 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  33.9 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  34.81 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  33.9 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  35.03 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  35.96 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  37 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  33.9 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  36.45 
 
 		 464 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  33.7 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  33.9 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  33.7 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  35.47 
 
 		 425 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  33.7 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  33.7 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.7 
 
 		 215 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  31.53 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  33.7 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  34.46 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  33.7 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 		 488 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.12 
 
 		 429 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  36.14 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  34.59 
 
 		 472 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.02 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.12 
 
 		 410 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  33.68 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  31.79 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  33.15 
 
 		 401 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  33.82 
 
 		 556 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  33.15 
 
 		 401 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  31.89 
 
 		 575 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.71 
 
 		 431 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  34.24 
 
 		 400 aa  98.2  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  32.09 
 
 		 431 aa  97.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  30.59 
 
 		 464 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  31.51 
 
 		 469 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  34.09 
 
 		 426 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.77 
 
 		 470 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.2 
 
 		 466 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  30.73 
 
 		 422 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  31.43 
 
 		 557 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.9 
 
 		 471 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.04 
 
 		 410 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  32.26 
 
 		 403 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  35.26 
 
 		 545 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  31.41 
 
 		 581 aa  94.7  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  33.33 
 
 		 466 aa  94.7  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  33.73 
 
 		 429 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  32.56 
 
 		 426 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  35.5 
 
 		 367 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  32.2 
 
 		 466 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  32.2 
 
 		 413 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.25 
 
 		 410 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  33.7 
 
 		 403 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  32.77 
 
 		 466 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  32.09 
 
 		 422 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  32.02 
 
 		 561 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  33.53 
 
 		 421 aa  92.8  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  30.94 
 
 		 459 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  34.16 
 
 		 510 aa  92.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  32.2 
 
 		 537 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.16 
 
 		 460 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.9 
 
 		 472 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>