282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0762 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 
510 aa  1017    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  62.45 
 
 
510 aa  631  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  32.24 
 
 
536 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.65 
 
 
562 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.06 
 
 
548 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.18 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  33.83 
 
 
557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.18 
 
 
514 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  27.01 
 
 
464 aa  127  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  31.17 
 
 
367 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  35.32 
 
 
268 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  25.76 
 
 
689 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  31.03 
 
 
367 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.61 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  26.01 
 
 
689 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  32.55 
 
 
425 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  28.24 
 
 
472 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  25.11 
 
 
687 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.04 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  27.49 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  27.81 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  25.88 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  25.11 
 
 
688 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  24.7 
 
 
690 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  26.78 
 
 
488 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  24.35 
 
 
688 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.36 
 
 
425 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  27.05 
 
 
410 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  28.76 
 
 
431 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  32.11 
 
 
575 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  26.98 
 
 
426 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  26.47 
 
 
417 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  25.46 
 
 
449 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.64 
 
 
367 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  25.89 
 
 
428 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  28.22 
 
 
459 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  36.08 
 
 
206 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  27.91 
 
 
459 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  24.83 
 
 
405 aa  104  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.88 
 
 
424 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25 
 
 
418 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  24.77 
 
 
430 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.77 
 
 
430 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  27.06 
 
 
460 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  24.77 
 
 
430 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  38.76 
 
 
421 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.59 
 
 
466 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.06 
 
 
460 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  27.69 
 
 
466 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.92 
 
 
428 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  26.65 
 
 
466 aa  101  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.06 
 
 
460 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  36 
 
 
206 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  27.99 
 
 
367 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.41 
 
 
440 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  26.14 
 
 
566 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  26.08 
 
 
409 aa  100  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  25.67 
 
 
466 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  28.96 
 
 
222 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  24.36 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  36.5 
 
 
429 aa  99.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  26.98 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  28.96 
 
 
222 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  26.2 
 
 
473 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  35.94 
 
 
206 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  28.53 
 
 
442 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.98 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  26.82 
 
 
222 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  27.83 
 
 
575 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  25.35 
 
 
428 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  26.41 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  26.61 
 
 
459 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  36.5 
 
 
429 aa  99  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.16 
 
 
445 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.2 
 
 
473 aa  99  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.4 
 
 
439 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  26.41 
 
 
224 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  26.27 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.46 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.76 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.3 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  23.23 
 
 
422 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  26.33 
 
 
426 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  24.94 
 
 
422 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.32 
 
 
459 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  27.65 
 
 
222 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  26.7 
 
 
215 aa  97.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  29.03 
 
 
218 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.93 
 
 
460 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.52 
 
 
431 aa  97.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>