279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0291 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  62.9 
 
 		 557 aa  664    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 562 aa  1124    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  43.04 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.58 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.09 
 
 		 471 aa  289  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.12 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.26 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  33.65 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  33.17 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  26.97 
 
 		 431 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  29.46 
 
 		 224 aa  97.4  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  29.46 
 
 		 224 aa  97.4  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  27.18 
 
 		 367 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  26.58 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  33.62 
 
 		 268 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  25.17 
 
 		 688 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  26.15 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  26.17 
 
 		 689 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  31.9 
 
 		 425 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  36.77 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.36 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  38.52 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.64 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  28.12 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.39 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25 
 
 		 562 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  27.6 
 
 		 408 aa  87.8  5e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  29.81 
 
 		 408 aa  87.4  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  25.92 
 
 		 451 aa  87.4  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  24.51 
 
 		 688 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  27.62 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  36.72 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  24.6 
 
 		 690 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  26.47 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.22 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  34.9 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  24.89 
 
 		 688 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  25.59 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  25.09 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  27.35 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  26.37 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.58 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.73 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  30.89 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.1 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.43 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  24.01 
 
 		 449 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  30.89 
 
 		 215 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.91 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  26.25 
 
 		 367 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  26.44 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.18 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.64 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  24.64 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  29.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.44 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  32.14 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  30.77 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  30.77 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  25.53 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  24.89 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  22.73 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  23.17 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  24.51 
 
 		 687 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  28.89 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.6 
 
 		 445 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  26.53 
 
 		 459 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  29.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.64 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  27.89 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  28.51 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2708  Cytochrome b/b6 domain  29.32 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000216389  unclonable  0.0000000000381098 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  30.96 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  30.42 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.64 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3110  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  29.32 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.176083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.7 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.16 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  24.58 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  26.12 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.37 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>