285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2130 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  99.11 
 
 		 224 aa  456  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  93.75 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  43.05 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.5 
 
 		 215 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  43.5 
 
 		 215 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  44.59 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  43.69 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  44.75 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  43.24 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  43.24 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  43.24 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  42.34 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  42.79 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  42.79 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  43.24 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  43.24 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  42.79 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  42.79 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  42.79 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  42.79 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  42.73 
 
 		 575 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  40.55 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.44 
 
 		 466 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  42.27 
 
 		 469 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  42.13 
 
 		 257 aa  171  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  41.01 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  38.57 
 
 		 422 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  40.83 
 
 		 431 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  39.91 
 
 		 464 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  41.18 
 
 		 466 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  39.01 
 
 		 367 aa  164  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  40.54 
 
 		 466 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  42.11 
 
 		 426 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  39.55 
 
 		 459 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  39.64 
 
 		 466 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.17 
 
 		 460 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.09 
 
 		 460 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  39.09 
 
 		 459 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  39.09 
 
 		 459 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  40.62 
 
 		 421 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  39.17 
 
 		 460 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.09 
 
 		 460 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.17 
 
 		 460 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.09 
 
 		 459 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  39.01 
 
 		 367 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  38.22 
 
 		 422 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  38.57 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  38.57 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  39.46 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.95 
 
 		 404 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.95 
 
 		 404 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  39.46 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  38.12 
 
 		 410 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.46 
 
 		 403 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.18 
 
 		 431 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  38.67 
 
 		 433 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.95 
 
 		 404 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  37.67 
 
 		 403 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  38.84 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  38.39 
 
 		 426 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  35.43 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.01 
 
 		 410 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.91 
 
 		 410 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  38.57 
 
 		 414 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.2 
 
 		 429 aa  154  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40 
 
 		 470 aa  154  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  37.67 
 
 		 408 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  36.36 
 
 		 425 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  40.65 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.48 
 
 		 367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.63 
 
 		 460 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.82 
 
 		 488 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  39.19 
 
 		 478 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  37.39 
 
 		 367 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  39.09 
 
 		 460 aa  151  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  39.3 
 
 		 459 aa  151  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.55 
 
 		 423 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.82 
 
 		 467 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  38.74 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  38.64 
 
 		 460 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.74 
 
 		 469 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  39.91 
 
 		 429 aa  148  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.95 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>