284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2711 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  71.25 
 
 		 257 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  44.19 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  43.54 
 
 		 575 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  41.47 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.27 
 
 		 488 aa  185  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  41.18 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  40.27 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  40 
 
 		 218 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  38.39 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  39.52 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  39.52 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  38.1 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  38.39 
 
 		 218 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  40.28 
 
 		 215 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  38.1 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  39.05 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  38.39 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  38.39 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  38.39 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  39.81 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  38.97 
 
 		 222 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.34 
 
 		 215 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  37.14 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  37.14 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  41.63 
 
 		 367 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  36.54 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.71 
 
 		 367 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  37.5 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  40.77 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  41.11 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  34.71 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.14 
 
 		 410 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  34.75 
 
 		 431 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  43.96 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  37.3 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  37.23 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.84 
 
 		 358 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  34.53 
 
 		 690 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.71 
 
 		 409 aa  134  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  34.62 
 
 		 488 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.4 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  34.75 
 
 		 472 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  36.41 
 
 		 422 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.11 
 
 		 562 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  32.73 
 
 		 688 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  33.33 
 
 		 408 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  33.95 
 
 		 464 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  32.73 
 
 		 689 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  32.27 
 
 		 464 aa  128  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  33.98 
 
 		 442 aa  128  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  33.49 
 
 		 421 aa  128  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  33.78 
 
 		 408 aa  128  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  33.04 
 
 		 469 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  35.66 
 
 		 421 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  32.27 
 
 		 688 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.84 
 
 		 431 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  33.03 
 
 		 426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  32.14 
 
 		 449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  35.93 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.96 
 
 		 425 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  32.73 
 
 		 689 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.8 
 
 		 445 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  34.9 
 
 		 459 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  33.5 
 
 		 451 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  31.25 
 
 		 445 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.25 
 
 		 445 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  29.88 
 
 		 428 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  35.58 
 
 		 400 aa  125  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.85 
 
 		 420 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  33.02 
 
 		 414 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  36.17 
 
 		 421 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.19 
 
 		 429 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.17 
 
 		 421 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  32.86 
 
 		 413 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  31.82 
 
 		 687 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  31.63 
 
 		 422 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  31.65 
 
 		 423 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  33.48 
 
 		 404 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  32.27 
 
 		 422 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  32.51 
 
 		 426 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  34.42 
 
 		 410 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  35.64 
 
 		 421 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  31.38 
 
 		 415 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  31.54 
 
 		 466 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  32.37 
 
 		 428 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.94 
 
 		 466 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.78 
 
 		 424 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  30.91 
 
 		 688 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.29 
 
 		 418 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>