285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0206 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  44.44 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  42.51 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  42.51 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  42.86 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  42.86 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  42.51 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  42.03 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  42.03 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  42.03 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  41.06 
 
 		 218 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  41.06 
 
 		 218 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  42.51 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  42.03 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  42.51 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  41.55 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  40.65 
 
 		 224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  42.03 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.03 
 
 		 215 aa  180  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  40.19 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  42.03 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  39.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  40.69 
 
 		 575 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  40.2 
 
 		 268 aa  165  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.39 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  40.5 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  39 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.13 
 
 		 562 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  39.5 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.56 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  43.23 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  37.11 
 
 		 431 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  35.5 
 
 		 422 aa  147  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.27 
 
 		 410 aa  147  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  40.21 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  41.36 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  38.1 
 
 		 267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  35.44 
 
 		 367 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  40.5 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  36.04 
 
 		 367 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  35.53 
 
 		 426 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  34.48 
 
 		 469 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  38.27 
 
 		 426 aa  141  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.55 
 
 		 410 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.98 
 
 		 488 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0458  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.5 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.27 
 
 		 423 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  37 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  37.24 
 
 		 403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  44.59 
 
 		 451 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  44.59 
 
 		 451 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  34.98 
 
 		 464 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  43.95 
 
 		 451 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  33.99 
 
 		 413 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  36.55 
 
 		 367 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.52 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  36.55 
 
 		 367 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  37.07 
 
 		 257 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  34.72 
 
 		 421 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.12 
 
 		 425 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  36.73 
 
 		 421 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  35.03 
 
 		 403 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  33.49 
 
 		 403 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.49 
 
 		 404 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.49 
 
 		 404 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.01 
 
 		 404 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  33.67 
 
 		 410 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.59 
 
 		 448 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.24 
 
 		 431 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  33.16 
 
 		 410 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  37.7 
 
 		 690 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.02 
 
 		 466 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  34.52 
 
 		 459 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  32.55 
 
 		 466 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  36.98 
 
 		 688 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  34.01 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32 
 
 		 460 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.5 
 
 		 460 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  33.5 
 
 		 460 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.83 
 
 		 470 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  33.16 
 
 		 422 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32 
 
 		 460 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.5 
 
 		 460 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  33.5 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  33.5 
 
 		 466 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  32.99 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  34.17 
 
 		 400 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  33.16 
 
 		 414 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.5 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  35.42 
 
 		 689 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>