284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1137 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  88.74 
 
 
222 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  88.29 
 
 
222 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  88.29 
 
 
222 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  86.94 
 
 
222 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  85.19 
 
 
218 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  86.92 
 
 
215 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  83.33 
 
 
218 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  86.26 
 
 
215 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  84.72 
 
 
218 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  84.72 
 
 
218 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  84.72 
 
 
218 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  83.33 
 
 
218 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  85.31 
 
 
215 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  82.87 
 
 
218 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  82.87 
 
 
218 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  82.87 
 
 
218 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  82.87 
 
 
218 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  44.75 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  44.29 
 
 
224 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  43.38 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  42.18 
 
 
431 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.08 
 
 
431 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.91 
 
 
367 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  37.1 
 
 
422 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  37.91 
 
 
367 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  42.18 
 
 
426 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  37.91 
 
 
367 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  40.99 
 
 
421 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  40.27 
 
 
429 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  37.91 
 
 
367 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  36.84 
 
 
469 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  35.27 
 
 
575 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  41.8 
 
 
267 aa  161  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  35.89 
 
 
464 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  36.36 
 
 
268 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  38.57 
 
 
367 aa  158  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  41.36 
 
 
429 aa  158  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  34.67 
 
 
466 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  34.75 
 
 
269 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.81 
 
 
562 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  35.07 
 
 
408 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.77 
 
 
425 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.71 
 
 
410 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  34.62 
 
 
267 aa  155  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  37.14 
 
 
466 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.36 
 
 
466 aa  154  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  36.19 
 
 
403 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  36.67 
 
 
478 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  35 
 
 
459 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.11 
 
 
469 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  38.65 
 
 
394 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  36.36 
 
 
413 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35 
 
 
460 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  37.14 
 
 
428 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.55 
 
 
460 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35 
 
 
460 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.48 
 
 
470 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.1 
 
 
428 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  42.03 
 
 
212 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.55 
 
 
460 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  35 
 
 
460 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  36.54 
 
 
249 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  37.25 
 
 
415 aa  152  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  34.76 
 
 
404 aa  151  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  33.78 
 
 
466 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.67 
 
 
471 aa  151  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  34.76 
 
 
403 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.71 
 
 
488 aa  151  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.45 
 
 
460 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  34.29 
 
 
404 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  34.45 
 
 
410 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  36.36 
 
 
430 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.67 
 
 
420 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  33.97 
 
 
410 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.28 
 
 
689 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.09 
 
 
459 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  37.75 
 
 
416 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.81 
 
 
403 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.36 
 
 
467 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  33.33 
 
 
466 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  37.75 
 
 
416 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>