More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1718 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  87.97 
 
 		 429 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  100 
 
 		 429 aa  851    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  79.02 
 
 		 431 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  82.75 
 
 		 421 aa  633  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  78.48 
 
 		 422 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  83.02 
 
 		 426 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  71.13 
 
 		 431 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  39.18 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  38.32 
 
 		 367 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  37.75 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.81 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  37.75 
 
 		 367 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  41.1 
 
 		 218 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  41.1 
 
 		 218 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  41.67 
 
 		 218 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  41.55 
 
 		 218 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  40.64 
 
 		 218 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.4 
 
 		 215 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  40.64 
 
 		 218 aa  183  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  41.47 
 
 		 215 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  40.64 
 
 		 218 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  40.64 
 
 		 218 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  41.47 
 
 		 215 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  40.18 
 
 		 218 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  39.82 
 
 		 222 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  39.82 
 
 		 222 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  34.3 
 
 		 575 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  40.72 
 
 		 222 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  41.18 
 
 		 222 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  39.73 
 
 		 218 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  40.27 
 
 		 222 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  33.06 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  31.18 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  41.47 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  34.77 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  32.55 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  33.76 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  30.24 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  31.37 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  32.52 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  33.12 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.12 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  31.1 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.2 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.12 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  39.91 
 
 		 224 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  39.45 
 
 		 224 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.24 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  31.25 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  32.91 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  32.05 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  35.64 
 
 		 268 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.34 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  30.92 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3229  cytochrome b/b6-like protein  33.51 
 
 		 467 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  38.39 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  30.66 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.48 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  32.9 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  32.17 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  30.72 
 
 		 688 aa  156  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.33 
 
 		 466 aa  156  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3092  cytochrome b/b6, N-terminal  34.27 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.71 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.66 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  30.89 
 
 		 747 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  32.22 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  30.38 
 
 		 416 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.95 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  30.61 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  30.61 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  31.98 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  30.38 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  30.38 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  30.38 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  31.22 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.13 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  33.72 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  30.72 
 
 		 687 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.54 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  31.62 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.38 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>